【摘 要】
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目的:在感染性疾病中,精准、快速的病原学诊断能及时指导临床用药,对于患者的治疗及预后至关重要。本文拟对比宏基因组二代测序与传统病原学检测结果的阳性率及与最终临床诊断的符合度,分析二代测序在感染性疾病病原学诊断中的应用价值及其不足。方法:本研究为回顾性病例分析研究,收集2018年5月至2020年4月在广西医科大学第一附属医院就诊,考虑感染性疾病收住感染科的患者72例。采集患者血液、骨髓液、脑脊液等标
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目的:在感染性疾病中,精准、快速的病原学诊断能及时指导临床用药,对于患者的治疗及预后至关重要。本文拟对比宏基因组二代测序与传统病原学检测结果的阳性率及与最终临床诊断的符合度,分析二代测序在感染性疾病病原学诊断中的应用价值及其不足。方法:本研究为回顾性病例分析研究,收集2018年5月至2020年4月在广西医科大学第一附属医院就诊,考虑感染性疾病收住感染科的患者72例。采集患者血液、骨髓液、脑脊液等标本,每个患者的标本分为两份,分别行传统病原学联合检测和二代测序。对两种不同的检测方法所得到的结果的阳性率、与最终临床诊断的符合度进行比较分析。结果:本研究共纳入72例患者,其中通过传统病原学检测方法,包括涂片镜检、病原体培养、病毒核酸检测,得到阳性结果的为18例,通过二代测序得到阳性结果的为47例,两者相比,二代测序具有更高的阳性检出率,25.00%vs65.28%（P=0.000）。病毒方面传统检测方法及二代测序分别检出1例、20例,阳性率1.39%vs27.78%（P=0.000）。在细菌方面,传统检测方法与二代测序分别检出5例、27例,阳性率6.94%vs37.50%（P=0.000）。真菌方面,传统病原检测方法检出13例,二代测序检出11例,阳性率18.06%vs15.28%（P=0.655）。寄生虫及立克次体均只在二代测序中检出,其中寄生虫为3例,立克次体为1例,传统病原检测方法未检出阳性。传统病原检测阳性结果18例,其中15例结果与最终临床诊断相符,二代测序阳性结果47例,17例检测结果与最终临床诊断相符,符合度83.33%vs36.17%,（P=0.01）。结论:在感染性疾病病原学检测中,二代测序相较于传统病原学检测方法,其阳性率更高。其中二代测序在病毒、细菌的检出方面阳性率更高,而在真菌的检出方面无显著差异。寄生虫、立克次体目前没有培养方法,临床缺乏病原体确诊依据,二代测序对寄生虫、立克次体感染方面的诊断具有一定优势与应用价值。两种检测方法结果与最终临床诊断符合度相比,传统检测方法结果符合度高于二代测序。
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