巴基斯坦信德人及旁遮普人的岩藻糖基转移酶3基因的分子遗传学分析

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研究背景及目的:岩藻糖基转移酶3基因(fucosyltransferase 3,FUT3)是编码岩藻糖基转移酶III(FucT-III)合成的基因,FucT-III是调控Lewis型抗原产生和决定Lewis表型的关键酶,故FUT3又叫做Lewis基因。研究显示FUT3具有高度多态性和明显的种族特异性和地理区域差异性。目前为止,很多国家和种族的FUT3基因数据和分布特征已被报道,然而巴基斯坦这个多种族国家尚无这些基础数据。因此,本研究选取了巴基斯坦两个具有代表性的种族——信德人和旁遮普人为研究对象,利用DNA测序技术对FUT3基因编码区进行了系统的序列分析,调查FUT3基因的遗传变异和Lewis表型的分子学基础。研究方法:利用Sanger测序技术对200个信德人和157个旁遮普人的FUT3基因整个编码区进行测序分析;采用分子克隆技术和等位基因特异性PCR方法进行单倍型鉴定;利用Polyphen和PROVEAN两种软件预测新错义突变对酶活性的影响;利用统计学软件对两个群体的等位基因及基因型频率进行比较分析。结果:本研究在所调查的两个群体中共发现23种单核苷酸变异,其中包括7个新的突变,16个已知变异点,所有新发现的错义突变均与报道过的致Lewis酶失活突变连锁存在;研究共鉴定出11种新的Lewis等位基因;除野生型等位基因外,le202,314和le59,1067是两个群体中频率最高的等位基因,然而后者在旁遮普人群的频率明显高于信德人群;两个群体中鉴定的Lewis阴性表型频率分别是11.5%(信德人)、22.93%(旁遮普人);软件预测结果显示,G490A和T959C两种错义突变可导致Lewis酶活性缺失。结论:1、本研究首次报道了巴基斯坦地区信德人和旁遮普人群的Lewis基因位点的等位基因频率分布;发现了两个群体的Lewis等位基因具有高度的序列多态性;发现了11个新的Lewis等位基因;2、DNA测序结果表明巴基斯坦信德人和旁遮普人的Lewis基因结构特征和等位基因频率分布基本一致;3、与其他人群的Lewis基因频率分布比较分析显示,信德人和旁遮普人的频率分布特征最接近于南亚的僧加罗人和高加索人。
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