党的十九大报告提出,创新支撑现代化经济体系,而上市公司的创新离不开良好的内部控制。随着我国财政部等五部委颁布《企业内部控制基本规范》、《企业内部控制配套指引》等系列文件,企业以及投资者逐步认识到内部控制的重要性。由于审计和监管环境的不成熟、法律法规制度的不健全、企业管理层的趋利动机导致凌驾于控制之上等诸多因素,导致我国上市公司如今普遍存在内部控制缺陷,这些内部控制缺陷影响着企业的管理运行和可持续发展。为应对上市公司财务舞弊造假行为,证券监管部门要求企业委托会计师事务所出具内部控制审计报告,注册会计师签字确认。自2011年新华制药被出具第一份内部控制审计否定意见报告后,每年被出具内控否定意见的上市公司呈增长趋势,上市公司暴露出的内部控制缺陷越来越多。在这一背景之下,研究我国上市公司内部控制审计否定意见,分析其内部控制存在的重大缺陷和改进措施能够促进我国上市公司内部控制体系的发展。本文主要采用文献综述法及案例分析法分析研究中珠医疗的内部控制情况,首先运用文献综述法,归纳整理与内部控制审计相关的文献资料,当前国内外文献主要在内部控制的框架构建、内部控制审计的发展过程、内部控制审计意见类型以及内部控制缺陷的概念界定、影响内部控制缺陷的因素方面研究较为深入全面,可以作为研究中珠医疗内部控制情况的理论基础;然后再运用案例分析法首先分析2018年被出具内部控制否定意见的52家上市公司整体情况,探讨否定意见的整体现状、出具否定意见的原因类型、内部控制缺陷披露情况以及自评报告披露情况;再选取中珠医疗为具体案例,通过搜集中珠医疗的内控审计报告、财务报表审计报告、内控自我评价报告等公开披露的信息,从内部控制五要素出发,对其组织架构、资金管理、担保业务、关联方交易、信息披露等方面存在的重大内部控制缺陷进行研究。通过对出具否定意见的52家上市公司整体情况分析和具体案例中珠医疗的分析,从内部控制五要素进一步研究得出导致公司内部控制缺陷的原因主要有以下几点:控股股东及关联方违规占用资金,重大投资项目合同未经领导审批,X对外披露信息不及时、不完整。本文根据分析出的原因提出以下几点建议:健全关联方资金占用管理制度,加强关联方交易风险评估,完善业务审批流程,提高公司信息披露的质量和积极性等具体的内部控制优化措施,改善中珠医疗的内部控制情况。通过本案例的研究,有助于深入了解内部控制审计否定意见的出具标准及企业的内部控制缺陷,对强化企业内部控制体系建设、提升企业经营管理效率、加强企业资金管理提供有益借鉴。