论文部分内容阅读
microRNA是一种22nt左右的小分子非编码RNA,在转录后水平调控基因的表达。作为哺乳动物中最重要的调控分子之一,microRNA几乎参与到所有重要生命活动的的调控中,包括包括细胞周期调控,干细胞的分化,癌细胞的分化,发育,细胞凋亡,物质和能量代谢,神经系统的发育以及正常功能的维持等诸多的重要生理过程。高等真核生物大约30%的基因受到miRNA调控,受调控的基因包括转录因子,酶,信号蛋白等。由于miRNA的靶点涉及各种功能相关的大量基因,因此miRNA与其靶点的相互作用很可能会形成复杂的相互作用关系,这些相互作用进一步与细胞内的其他信号网络作用形成更加复杂的网络。虽然已经对miRNA进行了广泛的研究,但是这些研究更多的是集中在证明miRNA对某一生命过程中的某一个或少数几个基因存在调控作用,或者miRNA调控作用与少数几个元素的关系,这种研究方式只能使我们从分子水平局部的理解microRNA的调控作用。对于在更大范围上,miRNA对其靶点的调控是如何与到细胞内的其他信号网络进一步形成更复杂的调控网络,如何影响生物网络的尚不清楚。为此本文通过对已发表文献结果、数据的挖掘分析,获得了人海马神经元主要信号通路的分子相互作用数据,以及海马神经元中的microRNA表达数据。在这些数据的基础上我们使用miranda, targetScan, PITA三个microRNA靶点预测软件计算出了海马神经元中这些分子上的microRNA作用靶点,然后使用网络建模分析工具建立了人海马神经元中主要信号通路的调控网络,以及该网络受microRNA调控后形成的更复杂的网络,并计算分析了microRNA是如何与这个网络相互作用并影响这个网络的。分析结果显示,microRNA主要通过对信号通路中的酶,转录因子,adapter进行调控,以此与其他信号网络相互作用形成更复杂的网络,并改变了网络的大多数的参数。