RNA结合蛋白KSRP对miR-150生成的促进作用

来源 :河南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sddcx
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:miRNAs是一类短小的、内源性启动的RNA分子,它是一种非蛋白编码旳RNA,它对基因的转录后水平的表达调控主要通过翻译抑制或mRNA降解来实现的。在大多数情况下miRNA基因通过RNA聚合酶II催化转录成miRNA的初级转绿本(pri-miRNA)。转录后,miRNA的初级转绿本(pri-miRNA)被一个称为微加工处理器的复合体剪切,该处理器由DROSHA和DGCR8以及其他的蛋白质组成。DROSHA酶是一种RNase III,DGCR8是miRNA加工处理中一种至关重要的蛋白质。被剪切为长度为65个核苷酸的转绿本被称为前体miRNA(pre-miRNA)。核加工后,pre-miRNA被一个包含Exportin-5的复合体运送到细胞质中。一旦pre-miRNA被运送到细胞质中,Dicer就剪切掉pre-miRNA的环并生成一个大约22个核苷酸的miRNA的双链。成熟miRNA的功能链伴随着Argonaute(Ago2)蛋白一起被装载到RISC复合体中。理论上,miRNA的双链可以产生两个不同的成熟的miRNA。然而,与siRNA的双链类似,miRNA通常也只有一条链被引入RISC复合体并引导复杂体与目标mRNA结合并导致mRNA的降解或翻译抑制。显而易见,miRNAs在生命体中发挥着重要的作用,包括细胞的发育时序以及细胞的增殖,分化,凋亡和肿瘤发生。它的异常表达会导致机体功能的紊乱甚至疾病,肿瘤的生成。因而miRNAs也成为多年来生物学界研究的热门。在细胞中RNA与RNA结合蛋白相互作用形成核糖核蛋白(RNP)复合体。RNA结合蛋白可影响RNA的结构和RNA之间的相互作用,并在其生物合成,稳定性,功能,运输和细胞定位中发挥关键的作用。近期的研究发现,RBPs不仅可以与mRNA结合影响其稳定性,也可以影响miRNA的加工成熟。考虑到KSRP可以促进miRNAs的加工,而我们实验室主要研究miRNAs对红系分化的影响。通过芯片分析,寻找在红系分化中和KSRP同时上调的miRNAs分子,发现KSPR和miR-150同时上调。因此本研究从KSPR和miR-150入手。目的:研究RNA结合蛋白KSRP对miR-150加工成熟的影响。方法:通过”RBPDB”网站预测到KSRP是可以与miR-150的primary序列结合的RBPs之一。我们推测KSRP可以促进miR-150的加工。接着将过表达KSRP的质粒转染到K562细胞中,24 h后提取RNA和蛋白质,然后分别用real-time PCR和Western blot的方法确定KSRP过表达成功。之后分别针对实验组,阳性对照组和阴性对照组miRNA的primary、precusor、mature序列设计引物,用以检测primary、precusor、mature的表达差异。然后收集转染KSRP过表达质粒24 h后的细胞,提取RNA,反转录,再用实时定量PCR(real-time PCR)检测过表达KSRP后内源性miR-150的primary、precusor、mature的表达变化,并分别以let-7a和miR-23b作为阳性和阴性对照,结果发现KSRP在miR-150的加工调节中具有重要的作用。为了进一步验证KSRP对miR-150加工成熟的影响,构建一个在其3’UTR分别插入实验组,阳性对照组,阴性对照组miRNA初级转录本序列的GFP表达质粒。然后让KSRP的表达质粒与GFP的表达质粒共转入293TN细胞,在转染24h后检测GFP荧光强度的变化。接下来用western blot的方法检测GFP蛋白的变化,也验证了KSRP对miR-150加工成熟的影响。为了验证KSRP与miR-150是否通过结合发挥对miR-150的加工作用,通过RNA-IP实验验证KSRP与miR-150的结合作用。结果:与对照组相比,转入过表达KSRP质粒的细胞KSRP的mRNA和蛋白水平均出现显著性上调,表明KSRP过表达成功。然后检测过表达KSRP后内源性miRNA的primary、precusor和mature的表达变化。与对照组相比,miR-150的primary表达下调而precusor和mature的表达则上调。与对照组相比,let-7a的primary表达下调而precusor和mature的表达则上调。与对照组相比,mir-23b的primary、precusor、mature的表达量均无明显变化。这些现象共同说明了KSRP对miR-150的加工成熟有促进作用。然后又通过荧光成像进一步验证了此结果。与空白对照组相比,实验组GFP荧光强度减弱,阳性对照组GFP荧光强度也减弱,阴性对照组无明显变化。这些结果进一步说明了KSRP对miR-150生成的作用。随后又通过RNA-IP实验证实KSRP可以与miR-150相互结合。结论:1.KSRP对内源性的miR-150的加工成熟有促进作用。2.KSRP可以与miR-150相结合。3.KSRP通过与miR-150结合促进其加工成熟。
其他文献
采用将脂肪酸甲酯磺酸钠(MES)与洗涤剂常用表面活性剂复配的方法,研究了在洗衣粉配方中MES与LAS、AOS复配体系的去污性能及泡沫性能,以及MES中二钠盐的含量对去污力的影响。
总结陕西省火灾现状。介绍马尔科夫链预测原理。以陕西省2005-2014年每个季度的火灾起数为依据,运用马尔科夫链,对2015年四个季度的火灾起数进行预测。预测过程中,首先把数据
目的:研究影响医疗服务供需的因素,分析医疗服务供需的均衡状况以及现阶段中国"看病难、看病贵"的原因。方法:将State space—Cobweb模型引入医疗服务市场,通过医疗服务价格
随着社会经济的高速发展、生活压力的不断增加以及大气污染的日益严重,人们的环境意识越来越强,不管是城市绿地建设,还是住宅小区内的植被草坪、园艺景观,在城市规划或社区规
本文简要概述了奥斯汀的言语行为二分说,即"施事话语"和"记述话语"的区分说,但是,由于他的"施事话语"概念本身的不严格以及他的兴趣的扩展,他后来感到很难坚持"施事话语"和"
供热机组"以热定电"的运行要求大大降低了机组自身的调峰能力,成为风电等清洁能源消纳的重要限制因素。通过引入电锅炉,实现供热机组与电锅炉互动,是提升供热机组运行灵活性
公立医院作为直接服务群众的窗口,是体现党和人民群众血肉联系最紧密的纽带之一,但因生存发展需要,个别公立医院把精力主要集中在抓业务发展上,导致医院党的建设有所松懈,党
报纸
<正>乖离率(BIAS)一般是用于资本市场中测量股价偏离移动平均线大小程度的指标。在财务报表分析中可以采用改良的乖离率指标进行辅助分析。当营业收入线偏离营业成本线超出以
买手模式,三分靠买货,七分靠运营。买手技术可能是个人行为,但是商品制度却必然是企业组织行为,需要买手全程参与商品销售企划,与零售终端实施互动与合作。这种功能的实现,其
<正>2014年以来,铁矿石市场供大于求的矛盾日趋严重,价格一路大幅下跌,生产成本居高不下,钢铁企业亏损加剧,边际效益也降至人工成本的三分之一,现金流日益减少,资金安全受到