继十一五规划把物流产业作为十大振兴产业之一后，十二五规划再一次把大力发展物流业作为发展生产性服务业的重要内容。说明物流业在我国经济发展中起着举足轻重的作用。所以如何使物流行业更好更快地发展，业已成为学术界和实业界讨论的热点。在现代产业组织理论中，存在着两种假说，一是市场结构影响企业绩效，二是企业效率影响绩效。我们只有知道是哪个因素在绩效中产生作用，才能对症下药，采取措施提高企业绩效，从而提高整个物流行业的市场绩效。本文为了理清哪个因素影响着绩效，对我国物流行业市场结构、效率和绩效这三者的关系进行了研究分析。首先本文从行业集中度、行业壁垒和产品差异性分析了物流业的市场结构。发现我国物流行业市场集中度低，仍处于原子型阶段，行业壁垒低和产品差异性小。为了测量我国物流行业的效率，本文选取了52家物流企业，2005-2011年的数据，采用数据包络分析方法，运用Deap2.1软件，计算每个企业的相对效率，再利用bootstrap重抽样的原理，运用R软件，编写程序，估算这七年物流行业的效率水平。发现我国物流企业的技术效率普遍较低，特别是航空运输企业和部分港口物流企业，新型的现代物流服务业的效率普遍较高。近年来，造成技术效率低的主要原因是规模效率无效。接着，以净利润率作为绩效变量，市场集中度和市场份额作为市场结构变量，由DEA计算得到的效率作为效率变量，此外还有速动比率、资产负债率和PMI指数作为控制变量。建立回归模型。结果发现，从整个行业的角度，无论是长期还是短期，我国物流行业存在效率结构假说。从企业角度来看，也支持效率结构假说，包括X-效率结构假说和规模效率结构假说。从物流子行业来看，运输业和港口物流业支持X-效率结构假说和规模效率结构假说。但新型的现代物流服务业只支持X-效率结构假说。最后根据实证分析结果，提出改善我国物流业绩效的建议和措施。