口蹄疫(FMD)是由口蹄疫病毒感染引起猪、牛、羊等偶蹄动物的一种急性,烈性传染病,给我国畜牧业健康发展造成巨大威胁。目前,对于FMD大部分的研究主要集中于口蹄疫病理及病因上,而对宿主感染FMDV后肠道菌群的变化状况却鲜有报道。利用Illumina高通量测序技术,我们研究了口蹄疫病毒感染对乳鼠肠道菌群的影响。研究发现在门水平,与对照组相比,口蹄疫病毒感染显著提高了乳鼠肠道中Proteobacteria的丰度,而降低了Fusobacteria和Firmicutes的丰度。在属水平,与对照组相比,口蹄疫病毒感染显著降低了Fusobacterium的丰度。由此可见,口蹄疫病毒感染与乳鼠肠道微生物菌群多样性及物种丰度的变化存在关联性。为了进一步研究抗病毒状态下肠道菌群的情况,首先我们对I型干扰素的IFN-ε,δ,ω,αω亚型进行了研究。近几年的研究显示epsilon干扰素在病毒急性期感染期间并不会导致它的上调,它在FMDV感染的表达情况未见报道。首先我们通过建立检测小鼠epsilon干扰素的实时荧光定量方法,检测了乳鼠IFN-ε在感染前后及不同时间段的变化,发现IFN-εmRNA转录水平在乳鼠感染FMDV前后以及不同时间段并不会发生明显的变化,这与猿猴免疫缺损病毒、结核分枝杆菌、脑脊髓炎病毒、门果病毒等病原上的研究结果一致。干扰素δ,ω,αω显示具有一定的抗病毒活性,但它们是否具有抗FMDV活性尚未见报道。基于前人的研究,我们选择了IFN-ω7,IFN-δ8,IFN-αω作为此次的研究对象。将IFN-ω7,IFN-δ8,IFN-αω在原核表达系统中进行表达,利用亲和层析获得IFN-ω7,IFN-δ8,IFN-αω蛋白,首次证实IFN-ω7,IFN-δ8,IFN-αω具有抗口蹄疫病毒活性。总之,研究证实口蹄疫病毒感染与乳鼠肠道微生物菌群多样性及物种丰度的变化存在一定的关联性,并发现新型的抗病毒物质,该研究为下一步阐明宿主在抗病毒状态下的肠道优势菌群奠定了基础。