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遗传多样性是生物多样性的重要组成部分，且其表现形式是多层次的，对其研究也应该体现在多层次。本研究以2001-2002年从北京、山西和黑龙江三个地区收集的14份野生胡枝子属植物为材料，建立种质资源圃，从形态学标记、等位酶标记和RAPD标记三个方面进行了胡枝子属植物遗传多样性的研究。以17个重要形态学性状进行了胡枝子属植物形态学的鉴定与评价，利用基本统计分析、相关分析、因子分析、聚类分析对其中的14个关健形态学性状进行了统计学分析；以7种酶系统产生的18个等位酶位点进行了酶谱遗传学分析；RAPD标记共进行了60个十碱基随机引物的扩增。其主要结果如下： 1．对14个关健形态学性状指标的平均值、方差、标准差、变异系数等基本统计分析表明，胡枝子属植物不同种间以及种内居群间在这14个重要形态学性状上的遗传差异较大，变异系数达28.89～122.36％（全生育天数除外，变异系数为4.72％）。 相关分析表明，节间长度与株高、叶长、叶宽呈显著正相关，而与主茎节数呈显著负相关；叶长、叶宽、叶面积、千粒重四个性状相互之间存在极显著正相关；干重和单株种子产量两者之间存在极显著正相关；出苗率与千粒重之间存在显著负相关；生长习性与分枝数之间存在显著正相关；全生育天数与生长习性之间存在显著负相关。 因子分析表明，前五个主成分占了91.472％的变异，可以概括出几乎全部的变异，我们把可以概括大部分变异的三个因子分别命名为形态因子、产量因子和生长因子。 采用欧氏距离的聚类结果很好印证了传统的分类系统。 2．用改进的Tris-HCl复杂提取缓冲液（0.1％巯基乙醇，0.001mol／L乙二胺四乙酸，四钠盐，0.01mol／L氯化钾，0.01mol／L氯化镁，20％PVP 40 000加到pH7.5，0.1mol／L的Tris-HCl缓冲液中）开展等位酶分析，成功地获得了7种酶（过氧化物酶，多酚氧化酶，酯酶，天冬氨酸转氨酶，苹果酸脱氢酶，磷酸葡萄糖变位酶，磷酸葡萄糖异构酶）的清晰谱带。 18个等位酶位点标记的遗传学分析表明，胡枝子属植物14个居群平均每个位点等位基因数A的平均值为1.7437，多态位点的百分数P的平均值为54.62％，平均每个位点实际杂合度Ho、预期杂合度He平均值分别为0.3845、0.2598，Shannon’s information Index（I）的平均值为0.3782，杂合性基因多样度比率FST的平均值为0.4467，居群每代迁移数Nm的平均值为0.3096。 以Nei（1972）的遗传距离得到的聚类分析结果与形态学性状获得的结果基本一致。 3．以改进的CTAB法获得了较高质量的胡枝子属植物基因组DNA，可以很好地用于RAPD扩增研究。通过RAPD扩增反应体系的探索，获得了适于胡枝子属植物的RAPD扩增反应体系：扩增反应总体积为25μL时，DNA模板用量为75ng，Mg2+浓度2.1mmol／L，dNTP 终浓度 200 pmol／L，随机引物浓度为 0．2 pmlpL，10 X buffer2．SPL，TaqDNA聚合酶 1．5个单位。 本研究得到的适合于胡枝子属植物的RAPD扩增反应程序：94C预变性3min：94C变性305，36℃退火305，72℃延伸1＊in，循环45次：72℃延伸10＊in。 对60个来自Opron公司的十碱基随机引物进行了多态性筛选，其中54个00％能扩增出多态性谱带。20个引物的RAPD扩增共获得209个RAPD标记，其中多态性带182条，占总谱带数的87．08化 以办 ＊972)的遗传距离得到的系统聚类树状图与等位酶标记、形态学性状的聚类结果有相同的趋势。 4．对三个不同层次所反映的胡枝子属植物遗传多样性的综合评价表明，不同标记所反映出的遗传分化程度和多样性水平不同，其中以基因组DNA的RAPD标记所反映出的不同居群间的遗传差异最大，等位酶标记次之，形态学性状差异最小；但从整体上看，三个层次反映了胡枝子属植物居群间相似的遗传多样性格局。