2006年3月，全国人大十届四次会议审议通过的《中华人民共和国国民经济和社会发展第十一个五年规划纲要》中，明确将“支持海峡西岸经济发展”作为“促进区域协调发展”的一部分。2009年5月14日，国务院审议并通过《国务院关于支持福建省加快建设海峡西岸经济区的若干意见》，其强调建设以市场为导向、高新技术为支撑、产业转型升级为重点，培育壮大新兴产业，推动产业集聚，形成主导产业、特色产业、高新技术产业等协调发展的现代产业体系。建设现代产业体系是海峡西岸经济区转变经济发展模式的重要支撑，也是改善海峡西岸经济区在中国分工格局中劣势地位的重要途径。全文主要分成七章。第一章首先阐述了本文的研究背景，研究意义和目的，研究方法和创新之处以及相关概念的界定。第二章回顾了国内外现代产业体系建设相关理论。包括西方的产业结构演进理论，产业结构调整理论和产业空间集聚理论，国内关于产业结构及现代产业体系研究成果，为下文的分析提供理论基础。第三章实证海峡西岸经济区县域经济的收敛性，分析了三次产业发展趋势及三次产业内部结构演进，对海峡西岸经济区产业现状进行总结性评述，得出海峡西岸经济区三次产业取得的进展与存在的问题。第四章从空间角度探讨了海峡西岸经济区产业体系。首先比较了海峡西岸经济区与长三角经济区及珠三角经济区在综合实力、科技和人力资本、制造业结构及第三产业结构的差异，分析了海峡西岸经济区在三大区域的优势和劣势。借助空间计量经济学剖析了海峡西岸经济区县市三次产业的空间分布和布局成因。第五章阐述了海峡西岸经济区产业集群取得的成果，集群形成的原因及集群发展存在的问题。分析海峡西岸经济区产业集群的结构及空间集群分布。第六章讨论了海峡西岸经济区与台湾产业合作。通过考察海峡西岸经济区与台湾在产业和经济方面的基本状况，分析了其产业合作的可行性，同时阐述了海峡西岸经济区与台湾产业合作的具体领域。最后一章在前文的分析基础上，提出构建海峡西岸经济区现代产业体系的建议。