论文部分内容阅读
从新疆地区石河子、库尔勒、博勒的棉花根际土样中分离获得了68株铁载体产生菌,采用CAS法测定了其铁载体产生能力,进而采用BOXAIR-PCR、16S rDNAPCR-RFLP、16S rRNA全序列分析研究了供试铁载体产生菌菌株的遗传多样性,初步确定了其系统发育及分类地位。68株铁载体产生菌中,革兰氏阴性细菌(G~-)62株,占总数91.2%,革兰氏阳性细菌(G~+)6株,占8.8%。CAS法结果表明,G~+菌产铁载体能力强于G~-菌,不同地域来源菌株产铁载体的能力具有多样性。BOXAIR-PCR聚类分析中,供试菌株表现出了很大的特异性,菌株MS7、MS5和MK14单独聚类外,其余菌株在84.5%的相似性水平上分成11个群,其中,括1个大群、7个小群、3个由单菌株组成的群。供试菌株的16S rDNA PCR-RFLP图谱存在极大的差异,所有供试菌株在85.5%的相似性水平上分成10个群。BOXAIR-PCR分析结果和16S rRNA PCR-RFLP聚类分析的结果基本一致。根据16S rRNA PCR-RFLP聚类结果,选取了MK12、MK33、MK25、MK28、MK30、MB10、MK45、MK35、MK26和MB2等10个代表菌株测定了16S rDNA全序列构件系统发育树,10个代表菌株分别位于6个系统发育分支,其中,MK12、MK25、MB2和MB10处于分支1,该分支为假单胞菌属(Pseudomonas),但归属于不同的种群;MK33和MK26处于分支2,该分支包括霍氏肠杆菌属(Enerobacter)和成团菌属(Pantoea);MK28、MK30、MK35和MK45分别位于不动杆菌属(Acinetobacter),芽孢杆菌属(Bacillus),短状杆菌属(Brachybacterium)和产碱杆菌属(Alcaligenes)。从序列相似性看,MK12与皱纹假单胞菌Pseudomonas corrugata(EF153018)、MB2与铜绿假单胞菌Pseudomonas aeruginosa(AB305018)、MB10与恶臭假单胞菌Pseudomonas putia(AM184288),MK30与蜡样芽孢杆菌Bacillus cereus(EU163266)、MK35与短状杆菌属Brachybacterium sp.Phenol-A(DQ822566)、MK45与产碱杆菌属Alcaligenes sp.A72(DQ180141),MK33与霍氏肠杆菌属Enerobacter sp.Px6-4(EF175731)、MK26与成团泛菌Pantoea agglomerans(EU047555)的16S rDNA序列相似性都为99%;MK25与假单胞属Pseudomans sp.GP11(AF326375),MK28与不动杆菌Acinetobacter sp.GXY-2(EF514909)的16S rDNA序列相似性为98%。本文初次在短状杆菌属(Brachybacterium)发现铁载体产生菌。