本文通过对行政协议的内涵、性质、基本范畴以及立法现状的介绍,结合行政协议案件司法审查的现实意义与理论意义,阐述了我国行政协议司法审查过程中法律规定的具体行政协议类型不全面的问题、协议相对人出现不履行行政协议时行政机关行使优益权与采取何种救济途径问题、行政法律规范与民事法律规范在行政协议司法审查中适用冲突以及司法审查过程中存在的其他问题,并针对这些问题,提出可行性的解决方法。对行政协议案件进行司法审查的过程,即是一种行政诉讼的过程,换言之,是由法院对行政协议从签订到执行的整个过程是否有不合法问题进行审查。诸多学者对行政协议概念、受案范围、法律适用问题的探讨给行政协议的司法审查制度奠定了厚实的理论基础,实践中行政协议案件的频发,各种类型适用法律的情形,给行政协议的司法审查制度提供了大量的素材。由于《行政诉讼法》第一次将行政协议这个法律名词写入法律条文内,就法律条文和司法解释对其介绍的篇幅是极其有限的,规定的内容比较浅显也不够完善,所以,我国的行政协议的司法审查具有很强的现实意义与理论意义。我们通过从理论上分析了解行政协议,结合实践探讨行政协议司法审查过程中法律适用的问题以及解决的方法。