【摘 要】
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随着基因编辑技术日渐成熟,基因编辑作物不断涌现。本研究对PL3基因编辑水稻编辑位点进行检测研究,以期为基因编辑作物定量检测方法提供技术支持,满足基因编辑作物产品产业化
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随着基因编辑技术日渐成熟,基因编辑作物不断涌现。本研究对PL3基因编辑水稻编辑位点进行检测研究,以期为基因编辑作物定量检测方法提供技术支持,满足基因编辑作物产品产业化定量标识的需求。以PL3基因编辑水稻为研究对象,以焦磷酸测序、HRM(高分辨率溶解曲线)、双重微滴数字PCR为分析工具,对PL3基因编辑水稻编辑位点进行精准定量检测。(1)通过对PL3基因编辑型水稻编辑位点焦磷酸测序引物设计、引物有效性检测、基因分型定型检测、基因分型定量检测、盲样检测等试验,建立了PL3基因编辑水稻编辑位点焦磷酸测序检测方法。(2)通过PL3基因编辑型水稻编辑位点HRM引物设计、引物有效性分析,反应体系、反应条件优化及分型定量等试验,确定了HRM反应引物浓度和退火温度的最佳组合为0.4μmol/L和58°C,检出限不低于10%,建立了PL3基因编辑水稻编辑位点HRM检测方法。(3)通过PL3基因编辑型水稻编辑位点双重数字PCR引物和探针设计、反应体系的建立、定量范围检测、LOQ验证等试验,确定了数字PCR反应引物浓度和探针浓度分别为0.4μmol/L和0.15μmol/L,最佳退火温度为62.4℃,最低检出限为0.05%。建立了PL3基因编辑水稻编辑位点双重微滴数字PCR检测方法。因此本研究建立的3种检测方法灵敏度高、准确性强,可以用于PL3基因编辑型水稻编辑位点定性检测和精准的定量分析。
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