核酸测序技术的进步，特别是近年来全新的高通量核酸测序技术的发明和改进，使得测序工作朝着高度集成和专业化的方向发展。这给专业化的核酸测序实验室的数据和人员管理带来了挑战。通过分析研究核酸测序实验室的工作流程和管理体系，本文采用Java技术开发了一套基于实验流程管理的测序实验室的信息管理系统。系统为B/S体系，采用轻量级J2EE体系的Struts，Hibernate，Spring等较新的流行的开源框架，实现了多层架构的设计。系统层次清晰，层与层之间、模块和模块之间耦合度低，易于维护和扩展。系统具有跨平台属性，能部署在Windows，Linux等操作系统下。 本系统实现了对核酸测序实验流程的全方位跟踪管理，实现了对数据的采集、存储、整合、查询、导出等功能，规范了实验室相关人员的工作。系统的实施应用极大地提高了实验室的工作效率和管理水平。同时可为今后分子生物学、医学及其他学科的实验室信息管理系统的建设提供参考。