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三峡水利枢纽工程建成蓄水后，每年的1~4月成为人为控制水位变化的消落期，将形成落差高达30m的水库消落带，由人为控制水位变化，势必使河流的自然水利水文状态发生变化，从而对三峡水库的水环境产生影响。目前有学者通过室内研究硅藻的大量增殖，发现随着藻类细胞的增长，培养液中的N、P和Si含量都逐渐下降，但P的变化幅度并不是很大，而当培养液中的N含量减少到最低点时补充氮源，发现几乎停止增长的硅藻细胞又重新开始继续增长，因此N也可能是水体富营养化的诱发因子。在已有研究中，对三峡库区支流嘉陵江的水质情况研究并不多