滇池和星云湖都属于云南重点保护的九大高原湖泊之一，由于四季温暖，光照充足，水体中有大量含氮、磷的污染物注入，具备了形成富营养化和藻类生长的有利条件，这使近年来滇池和星云湖以微囊藻为优势种的蓝藻水华频繁暴发，并且微囊藻还能产生微囊藻毒素，严重危害着水体环境及人类的健康。鉴于目前对位于不同水系且污染程度不同的湖泊水华进行微囊藻产毒差异比较的研究还比较少见，本研究则选取了地理位置、所属水系、受到污染的历史与程度均不相同的滇池和星云湖作为研究对象，揭示了2008年4月-11月间滇池和星云湖微囊藻在MC-RR、MC-LR和MC总量产量上的差异。同时进行了微囊藻的分离纯化培养，对纯化后的微囊藻进行微囊藻毒素产量差异的分析。通过实验结果初步得出两湖泊微囊藻水华发生和产毒行为的季节变化规律，以及环境对MC-RR和MC-LR产生比例的影响，并为两湖微囊藻的危险性评价提供了一定的参考依据。　　 本研究对2008年滇池和星云湖蓝藻水华暴发期间的微囊藻及其毒素含量进行监测后得出以下一些结论：　　 1.滇池和星云湖野外微囊藻样产毒存在差异　　 (1)两湖微囊藻毒素都存在季节性变化的趋势。两湖新鲜藻样和干藻粉样，无论是MC-RR、MC-LR还是MC总量都表现出基本相同的季节性波动，4月-5月和10月11日是两湖泊产毒差异变化的两个转折点。　　 (2)滇池微囊藻毒素(MC-RR、MC-LR、总量及MC-LR占MC总量百分比)变化幅度较星云湖平缓。　　 (3)滇池微囊藻检出最高值月份较星云湖迟。　　 (4)两湖微囊藻检出量变化最剧烈月份分别在4-5月份和9-10月份。　　 2.通过纯化培养实验，证实了不同物化条件确实改变了同种微囊藻产毒状况　　 (1)两湖微囊藻细胞MC-RR的产量要明显大于MC-LR产量。　　 (2)星云湖微囊藻产MC-LR占MC总量百分比大于滇池。　　 (3)滇池纯化培养藻样铜绿微囊藻藻产MC-RR能力大于星云湖。