我国医疗机构的药品采购管理一直是一个很热门而且很敏感的话题:如何保证医疗机构在药品采购中的“公平、公正、公开”,如何提高医疗机构药品采购的效率保障临床用药,如何降低医疗机构药品的库存,如何对“问题药品”的流向进行管理及追回等等。在药品采购中引入第三方采购服务机构,并建立药品采购的第三方采购服务系统,以信息化、电子商务的手段加强对药品采购管理,无疑是解决上述问题的最佳选择。第三方采购服务系统在药品采购管理中的应用,目前处于起步阶段。无论是在运营模式上、还是在具体的操作中,都有需要问题需要研究和探讨:如何设计系统结构、搭建更灵活高效的第三方采购服务系统,如何解决药品采购管理中信息系统的安全问题、如何解决药品采购管理中的信息公正性问题、如何解决获取采购信息及时性、与采购各方系统数据对接的问题、如何解决资金结算问题等。本文提出了第三方采购服务系统在药品采购管理中的解决方案:设计了系统的总体结构和架设思路,以数字证书的电子认证技术来对用户进行身份认证及数据加密解决系统安全性问题,以第三方“时间戳技术”的应用解决采购过程中的“公正性”问题,提出“数据适配器”的方法将各方的数据标准予以转换解决上下游系统对接的问题,采用“信息引擎”使得采购信息可以更快捷、更便利地传递,使用引入银行信用的网上支付手段来解决资金流的问题。并在文中对时间戳技术、“数据适配器”、“信息引擎”等应用作了详细的阐述。通过在广东东莞、珠海及山东聊城等地方的药品采购管理工作中成功实施了第三方采购服务系统,对文中所提出的思路和方法做了全面的检验。为第三方采购服务系统在药品采购管理中的进一步研究,打下了坚实的基础。