农村集体土地产权制度是推进社会主义新农村建设以及建立和谐稳定社会的重大课题之一，也和农村、农业和农民等“三农”问题能够得以解决有着非常密切的关系。现有农村集体土地产权制度存在的缺陷已经阻碍了农村生产力的发展，针对目前农村集体土地产权制度存在的问题进行分析并进行综合的改革，已经成为促进农村生产力快速发展，保证农村社会和谐稳定的必然选择。本文以马克思产权制度理论为基础，同时运用西方产权理论，通过运用文献研究法、案例调查和分析法、归纳分析方法及同时运用微观与宏观、理论与实证相结合、历史与逻辑等方法，对灌云县以后农村土地产权综合制度改革方向和对策等方面进行探讨，并结合我国农村土地产权制度的变迁，分析灌云县现行的农村土地产权制度改革取得的成效和存在的问题，并借鉴国内外现行的土地产权制度，提出灌云县农村集体土地产权综合制度综合改革的实施方案、改革的内容及建议和保障措施。从完善土地产权的主体地位、加大土地流转方式的创新、建立土地交易市场、保障失地农民的充分保障及结业和切实推进土地征收补偿方式改革等方面制定改革的实施方案。改革在主要内容及建议为积极推广“农户联产承包”和积极鼓励成立农业专业合作社和农业企业进行土地规模化种植，加大农村土地的流传集中，大力推进农业现代化和机械化；大力推进集体土地征地补偿的改革的探索，在现有土地补偿安置方式基础上,因地制宜地进行土地补偿入股、收益分配和不同安置途径的探索；加大集体土地交易市场的建立，按照国有土地最底保护价制度，评定集体土农用地和集体建设用地的基准地价并定期向社会公开，并制定集体土地交易的指导价和相对稳定的交易场所，切实保护农民的土地财产权利；加大城乡统筹和城镇化的引导，保障农村集体的权益不受侵害；切实保护农村集体土地产权,在“六权”登记试点的基础上,建立农村的“六权”登记制度，切实保护农村集体土地的财产权利，维护农村社会的和谐稳定。并从组织保障、政策保障和资金保障等三方面分析改革的保障措施。