三峡库区山地丘陵发育，小流域众多，流域内居民以农民为主，以农业活动为主的土地利用方式构成了小流域内的农业生态经济系统。目前对小流域农业生态经济系统的评价是当前进行小流域可持续发展研究的热点问题，评价和监测可持续发展的状态和程度，是建立可持续发展的综合决策机制和协调管理机制的基础，是因地制宜寻求生产“自救”的基础依据。　　 本研究区位于三峡库区万州五桥区五桥河小流域这一相对闭合的生态经济系统单元，通过多次野外调研和实验，结合收集到的文献资料和室内数据分析，从评价五桥河流域山地农业生态经济系统的可持续性入手，找到影响系统可持续性的主要问题，并试图构建适应本区发展的新型的生态农业产业链，以优化配置系统内各种资源，缓解农业经济发展与农业生态环境之间的矛盾，研究结果如下：　　 1.运用生态足迹方法评价系统发展的可持续性，计算结果表明：2004年三峡库区五桥河流域每个居民平均需要1.0207 hm2的生物生产性土地维持基本生活消费，而实际可供给的生态承载力仅为0.4654 hm2，生态足迹需求达到生态承载能力的2.19倍，生态空间供给严重不足。五桥河流域生态足迹赤字高于全球水平，而资源利用效率数倍低于世界平均水平，该区发展所呈现的相对不可持续状态使得提高该区域资源利用效率手段不甚明朗。　　 2.通过分析区域的土地资源承载力发现：无论在何种营养标准下，本流域内主要产出的农作物的实际产量，即水稻、小麦、玉米、马铃薯和甘薯，均无法满足区域内居民的生活需求，呈现承载赤字；即便实际产量达到潜在产量，也仅能基本满足居民生物性生理需求的营养要求。当居民生活水平和食物消费质量提高，必然要求更高的营养水平，潜在产量下的承载人口力出现赤字。　　 3.为寻求优化的农业生产模式，本研究依托于不同农业模式试验，运用能值手段分析不同农业模式的生态效益和经济效益，将系统生态和经济层面的农业生产要素联系起来，优选出具有较好经济效益和环境效益的果—草—牧生态农业模式，能值评价指标体系结果体现了该模式可有效协调农业生产中生态环境与社会经济之间的矛盾，其优质高产和持续发展的势头给库区农业发展提供了可借鉴的模式。　　 4.在优选出的农业模式基础上，作者通过跟踪调查流域内经营多年的农业模式发现，生态农业模式的运营可依托高校、科研院所及政府进行技术开发和指导，形成农户—科研—政府三位一体，并面向以公司企业为媒介的加工增殖环节与直接消费市场两大消费层面，以实时的科技和市场信号注入农产品产供销过程，是较为成熟的生态农业模式。