在山羊中,安徽白山羊总体各项繁殖力参数较高,是安徽省皖北和江淮之间的广大平原、丘陵地区人民的重要生产资料,其经济效益依赖于它的总生产力,而这种总生产力更多的依赖于母羊的高产羔率。然而,有关于山羊繁殖性状的遗传力很低(0.09-0.14),较难过传统的育种方法来改进其遗传进展。因此研究者们将他们的目光聚焦于分子育种技术,以期快速提高山羊繁殖力。卵巢是动物体内重要的生殖器官之一,在生殖调控过程中发挥非常重要的作用,其排卵的多少影响个体产羔率的高低。MicroRNA(miRNA)是一类通过降解或干扰mRNA正常表达的方式来实现调控基因转录后表达的非编码小RNA。许多研究表明,miRNA在卵巢的所有生物学过程都起较重要的作用,包括卵泡形成、发育、凋亡,黄体形成与消失。为探索解释miRNA在山羊繁殖性状中产羔率方面所扮演的角色,期望筛选并鉴别某些miRNA序列可被用于后续研究以提高山羊排卵率及产羔率。在本研究中,我们使用高通量测序的方法,在产单羔和多羔的安徽白山羊母羊卵泡期卵巢中探测miRNA的各自表达谱,及其差异性表达情况,预测其潜在的候选miRNA,并对miRNA的靶基因进行了GO富集分析和KEGG通路分析。主要研究结果如下：1.对单羔和多羔安徽白山羊卵泡期卵巢小RNA文库进行高通量测序,两文库共获得12,000,000条原始序列(raw reads)。经质量处理后单羔和多羔文库分别得到5,945,145和5,948,837条纯净序列,分别对应235,735和160,284种不同的纯净序列。其长度分布主要位于20-24nt之间；其中以miRNA典型长度22nt的分布为波峰,在单羔和多羔文库中分别占到54.26%和56.93%。2.参照miRBase 20.0数据库中已有的所有动物miRNA及其前体序列(测得的miRNA不分物种),得到了较完整的山羊卵泡期卵巢miRNA表达谱及转录组特征信息：单羔和多羔各文库miRNA的表达主要集中在表达量前20位的miRNA上(均占所有miRNA总表达量的80%以上),其中let-7b在两组山羊卵泡期卵巢中表达量均是最高。3.对各miRNA进行标准化处理后,进行差异比较,单羔和多羔文库分别获得1441个和1317个物种间保守的已知miRNA,其中,1008个为共同表达,309个是多羔文库特异表达,433个为单羔文库特异表达；绝大多数特异miRNA的表达量极低,表达量未高于5,但多羔组中有4个、单羔组中有9个miRNA表达量高于1000,其中多羔组中最高表达的miR-29c表达量高达5214,单羔组中最高表达的miR-6406表达量高达42571。总共预测得到35个新的山羊候选miRNA。其中,8个是单、多羔文库共同表达的,9个是在多羔组中特异表达,18个是在单羔组中特异表达的。4.对单羔和多羔文库的miRNA的靶基因进行GO富集分析和KEGG通路分析。结果表明,GO富集分析中,miRNA的靶基因在两个文库中分别富集到不同的条目中,而且多羔组的显著富集条目全部被包含在单羔显著条目中；KEGG通路分析中,值得指出的是ABC transporters, Carbohydrate digestion and absorption, Peroxisome, Starch and sucrose metabolism,和Progesterone-mediated oocyte maturation(孕酮介导的卵母细胞成熟)通路被多羔组显著富集,这些显著富集的通路可能是机体为应对山羊多羔性状卵泡期的生理要求而显现出的。5.针对两文库共同表达的miRNA序列中,随机选取5个(miR-378a, miR-10a, miR-202-5p, miR-84a, and let-7d-5p,它们其中有3个是差异表达的)miRNA,通过qRT-PCR检测其表达水平以验证本次高通量测序的可靠性。结果所得的miRNA的表达水平与测序结果一致。