我国的独立审计制度是在政府有关部门的直接推动下建立和发展起来的,在发展过程中形成了政府多头监管,部门条块分割,区域市场分割,多宗行业相互竞争等不良秩序。为了提高审计行业的整体效率,中注协发布了《关于推动会计师事务所做大做强的意见》。本文以会计师事务所的审计生产效率为研究起点,从审计投入与产出的角度,运用数据包络分析方法估算了审计生产效率值,然后重点分析了审计师所面临的宏观制度环境和微观制度环境对审计生产效率的影响,在宏观制度环境中,本文运用了规范研究和实证研究相结合的方法,从对我国会计师事务所有普遍影响力和约束力的市场秩序和法律环境的视角,分析了行业竞争秩序,政府对市场的干预和法律环境对会计师事务所审计生产效率的影响,研究表明:市场秩序好,政府对市场的干预少,法律建设快的地区,审计师的生产效率较高,在微观制度环境中,我们同样运用了规范研究和实证研究相结合的方法,从审计师面对的客户公司的角度,研究了公司治理结构对审计生产效率的影响,研究表明:审计师面对国有股和非国有股控股的上市公司时,表现出了效率的差异;对于股权结构较为合理,股权制衡度较均衡的公司,审计师表现出了显著的高效率;独立董事和监事会都在一定程度上表现出了对外部审计机制的支持,但是独立董事的治理效应还应继续加强。制度具有关联性和相互依存性,一项制度的生效与失效与其他制度的生效与失效联系在一起,要提高审计师的生产效率和外部审计机制的监督效用,应从更为广泛的制度环境着手,包括加快市场化进程,建立良好的市场秩序,提高法制建设水平,规范政府行为,消除公司被控股股东和内部控制人操控的局面。