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通过对小麦黑胚病病原分离、病原的鉴定及致病性研究结果表明,引致新疆小麦黑胚病的病原由多种病原组成,确立了Alternaria consortiale (Thüm.) Hughes,Alternaria alternate (Fr.)Keissler与Bipolaris sorokiniana (SaccetSorokin)Shoems是引发新疆小麦黑胚病的主要致病原,A. consortiale可侵染小麦种粒且成为新疆小麦黑胚病的优势病源,这在我国文献的报道中尚属于首次。通过对小麦黑胚病病原侵染机制研究,3种主要病原菌均可侵染小麦植株但对麦粒的致病性表现持差异,A.consortiale和A. alternate对小麦苗期及成株期幼嫩组织侵染致病力弱,相反B.sorokiniana是这时期的主要致病原。进入小麦接穗期后却表现相反,B. sorokiniana对麦粒的致病力表现较弱,而苗期致病力强; A. consortiale与A. alternate适宜的侵染致病期均出现在小麦的乳熟期至黄熟期。在小麦黑胚病病原的侵染机制研究中,总表现在穗轴部位首先发病,然后由病变处的菌丝体穿透过小穗的基部再过渡到胚尖,才使得小麦的胚也感染变黑。实验结果已表明,大田环境高温多湿,是引致小麦黑胚病高发的首要成因。2004～2005年在新疆农业大学试验田,对25份小麦品种进行籽粒黑胚病抗感性差异田间鉴定,研究结果表明,不同品种对Alternaria alternate(Fr.) Keissler与Bipolaris sorokiniana (Sacc et Sorokin) Shoems引致的小麦黒胚病抗性不同。在单独接种链格孢的25份供试材料中未发现免疫品种,表现感病的品种有新春6号、新春8号、新春7号等9个品种,占鉴定总数的36%;表现中感的品种有新春2号、新春5号、8131等11个品种占48%;发病率低于6%的抗小麦籽粒黑胚病品种有新春15号、945-304、64--1、1-147等4个品种,仅占鉴定总数的16%。而单独接种根腐离蠕孢菌各材料的黑胚率调查结果表明:表现感病的品种有宁春4号、新春13号、新春9号等3个品种;新春2号等7个品种表现中感品种特征;新春15号、64—1等15个品种表现抗病,占鉴定总数的60%。试验调查了成熟小麦的株高、芒长、穗长与小麦黑胚病的相关性,分析表明种子发病率与小麦株高矮呈负相关,芒长、穗长与小麦籽粒发病率呈负相关性。解剖新春6号种粒的组织切片观察菌丝在小麦籽粒内部的生活状态显示,病原菌菌丝潜伏麦粒果皮下危害组织细