【摘 要】
:
分枝杆菌对人类社会影响巨大,比如结核分枝杆菌每年导致无数人感染和死亡。分枝杆菌感染、致病机理的研究对于相应药物和疫苗的开发意义重大。高通量测序技术的完善和发展改变了传统微生物学的研究方法,即从原来的已知表型找基因变成了解释已经基因序列的功能。随着1998年分枝杆菌的模式株Mycobacterium tuberculosis H37Rv全基因组的公布,分枝杆菌研究迈入了基因组学时代。这些基因组数据的
论文部分内容阅读
分枝杆菌对人类社会影响巨大,比如结核分枝杆菌每年导致无数人感染和死亡。分枝杆菌感染、致病机理的研究对于相应药物和疫苗的开发意义重大。高通量测序技术的完善和发展改变了传统微生物学的研究方法,即从原来的已知表型找基因变成了解释已经基因序列的功能。随着1998年分枝杆菌的模式株Mycobacterium tuberculosis H37Rv全基因组的公布,分枝杆菌研究迈入了基因组学时代。这些基因组数据的合理利用大大加速了分枝杆菌基因功能的研究,比如使用全基因组嵌合芯片鉴定分枝杆菌的基因组多态性已经成为现在的研究热点。另外,新的遗传分析手段的出现也使得寻找在分枝杆菌致病过程中起关键作用的基因变得比原来容易。鉴于此,近几年已经积累了大量的分枝杆菌基因组学数据,而如何管理利用好这些数据并为更多的研究者所用变得至关重要。本论文就是在充分细致的文献调研和需求分析基础上,对分枝杆菌的基因组学数据进行大规模的搜集、整理、校正和整合,并开发了相应的界面友好、功能强大实用的工具,进而形成了一个综合性的分枝杆菌基因组信息分析平台。该平台不但整合了基因组序列和注释等一般信息,也包括了从大量文献和我们自己的研究中提取的高质量的基因组多态性实验数据。更为重要的是,我们整合了分枝杆菌研究者最为关心的毒力基因、必需基因和操纵子结构等功能基因组学的数据。我们开发的工具功能很强大并且简单易用。用户不但可以根据自己的兴趣和需要查询相关的信息,也能够使用我们提供的工具进行基因组比对分析等复杂的操作,还能够把用户自己的数据也递交到平台中为其它分枝杆菌研究者所用。该平台的发布将会对于理解和分析分枝杆菌这类特殊的细菌的毒性机理、致病机制、基因组结构和分子进化起很大的帮助作用。
其他文献
胚胎干细胞(Embryonic Stem Cell, ESC)是一种具有无限增殖能力,和分化成三个胚层全部细胞的多潜能性(pluripotent)干细胞,被广泛地应用于发育生物学和再生医学等研究中。研究ES细胞自我更新相关基因具有极其重要的意义,RNA干扰技术是该项研究的关键技术之一。由于胚胎干细胞的特殊性,大多数的转染试剂转染胚胎干细胞的效率都非常低,为建立高效的慢病毒介导的RNA干扰系统和揭示
研究目的:急性排斥反应是肝脏移植术后常见的严重并发症,也是导致慢性排斥和移植物失功的重要原因之一,研究肝脏移植后免疫调节的机制有助于为急性排斥反应提供新的治疗手段。辅助性T细胞17(T helper 17 cells, Th17)以表达IL-17而得名,是不同于Thl、Th2的CD4+T细胞新亚群,在自身免疫性疾病、机体抗感染、肿瘤发生和器官移植排斥中发挥重要作用。业已证明,转化生长因子-β(tr
加权Lorentz空间和Orlicz-Lorentz空间是Lp空间和经典Lorentz空间Lp,q的重要推广形式,也是重排不变空间的主要表现形式.自从Lorentz空间及Orlicz-Lorentz空间被引进以来,它们一直是调和分析中的重要研究对象.本文主要研究这两空间的分析性质:差分模,连续模,Sobolev嵌入,Riesz收敛性质.它们是Lp空间和经典Lorentz空间Lp,q的分析性质的推广
探讨汉语反义词共现构式的互文性特征,发现互文性特征是汉语反义词共现构式在语义层面上的一个典型特征,这种特征的体现必须同时满足句法上的“形式对称”和语义上的“意义互补”两个限制性条件,其中,“意义互补”又体现为前后呼应组构成分的加合互补、中和互补、融合互补、关系互补以及省略互补五种情况。
在纤维素降解过程中,至少需要内切-β-1,4-葡聚糖酶(endo-P-1,4-glucanase, EG, EC 3.2.1.4)、外切-β-1,4-葡聚糖酶(exo-β-1,4-glucanase, CBH, EC 3.2.1.91)和β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase, BG, EC 3.2.1.21)三种成分的共同作用,但白蚁的内源性纤维素酶只包括内切-β-1,4-葡聚糖酶和β-葡萄
四种相互作用中,引力被研究的历史最长,但也是最后没有在局域量子场论的框架下被量子化的相互作用。人们普遍相信,对黑洞热力学的深入研究会有助于我们建立引力的量子理论。现在,黑洞热力学的研究已经被推广到以视界为边界的时空热力学体系中,即:时空热力学。由此,人们发现了一些引力所具备的普遍性质。我们知道,Einstein广义相对论是一个不可重整化的理论,人们也试图建立新的可重整化的引力理论。最近,Horav
研究目的:许多临床研究表明,应用芬太尼术后患者静脉自控镇痛,芬太尼的用量存在明显的个体差异。细胞色素氧化酶P450 3A4 (cytochrome P450 3A4, CYP3A4)是芬太尼的主要代谢酶,而CYP3A4基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)可能是导致芬太尼镇痛效果个体差异的原因。本研究旨在探讨CYP3A4*1G (CYP3
近年来,我国文化类综艺节目掀起了全新的热播浪潮,迈入了中国电视文艺的全新阶段。文化类综艺节目能够有效宣传、科普我国优秀传统文化。比如《上新了·故宫》《国家宝藏》《声入人心》等,这些文化类综艺节目都和其他文化产业进行了有机结合,实现了多个产业共同发展,显著提高了文化类综艺节目的长远发展能力,同时也为文化类综艺节目的产业化发展提供了很好的范本。本文主要针对文化类综艺节目产业化发展路径进行了深入全面的研
Phenylobacterium zucineum strain HLK1T是我们从肿瘤细胞k562细胞系中分离得到的兼性细胞内共生细菌。P.zucineum可以侵染并稳定生长繁殖于宿主细胞,但不影响宿主细胞生长和形态。基于16S rDNA的系统发育分析表明P.zucineum细菌属于alpha变形菌纲Phenylobacterium属。P.zucineum是Phenylobacterium属唯一
目的:观察防眩汤治疗椎动脉型颈椎病的临床疗效。方法:将148例椎动脉型颈椎病患者按照随机数字表法分为对照组72例和治疗组76例。治疗组给予防眩汤治疗,对照组给予盐酸氟桂利嗪胶囊治疗。比较两组患者的临床疗效及治疗前后颈性眩晕症状与功能评估量表(cerical vertigo symptoms and function evaluation scale, ESCV)评分、视觉模拟评分(VAS)、血流动