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本研究利用ITS序列及ITS-RFLP分析,分别对福建省食用菌种质资源库(福建农林大学菌物研究中心)保藏的灰树花、滑菇、黄伞、桑黄、姬松茸、猴头菇、虫草、黑木耳和毛木耳9个种进行了鉴定分类,清除了同名异种的菌株,并初步建立了各相关生物学种的鉴别技术。具体结果如下:1.选用了HhaⅠ、HaeⅢ和DraⅠ三种酶对32个灰树花菌株进行酶切片段多态性综合分析,发现Gr0004菌株的酶切片段不一样。通过测序,并与本实验室鉴定的侧耳属菌株杏鲍菇序列进行比对,判定其为一株杏鲍菇菌株。2.选用了NruⅠ和NcoⅠ两种酶对鳞伞属滑菇和黄伞菌株进行酶切片段多态性综合分析,发现种内菌株间酶切片段一致,而属内种间差异较大。这两种酶可以很好的将两者区分开;另外,ITS-RFLP分析结果和滑菇菌株出菇的子实体相吻合。3.采用拮抗实验及ITS序列分析,对6株桑黄菌进行了鉴定分类研究。拮抗实验结果表明,Ph.l 0001、Ph.l 0003、Ph.l 0003+1和Ph.l 0005与桑黄菌(Phellinuslinteus)菌落形态一致;Ph.l 0002和Ph.l 0004与其它菌株间拮抗线非常明显,其他菌株之间的拮抗线相对弱些;而ITS序列比对分析结果表明,Ph.l 0001、Ph.l0003、Ph.l 0003+1和Ph.l 0005 ITS序列比对相似性为99.86%,但Ph.l 0002和Ph.l 0004菌株之间及与其他菌株间均存在很大差异。通过试验,判定Ph.l 0001、Ph.l 0003、Ph.l 0003+1和Ph.l 0005为桑黄菌(Phellinus linteus);Ph.l 0004为Phellinus pini;而Ph.l 0002与Phellinus badius虽有一定的相似性(95%),但不能确定其具体种性。4.供试的27株姬松茸菌株扩增的ITS片段长度呈现多态性。根据ITS大小初步分成三类,一类是姬松茸;一类是曲霉属;一类初步判定是真姬菇。通过序列比对,选用了HaeⅢ和XbaⅠ对14个姬松茸菌株进行酶切分析,各菌株的酶切结果一致,表明14个姬松茸菌株种性一致,为同属同种品系,无差异性。5.根据本实验室对猴头菇种质资源遗传多样性研究结果,选择了H0003和H0029这两个遗传差异大的猴头菌菌株进行ITS克隆测序。选用BamHI对猴头菌进行了酶切分析,酶切结果与酶切分析不一致;后经酶切时间、酶切所用酶量的多次验证还是出现同样的结果。通过进一步的酶切转化子、克隆测序,初步判定猴头菌rDNA核基因组内可能至少存在两种ITS序列类型。6.通过对虫草属菌株ITS序列进行比对选用了ApaⅠ、HaeⅢ和AluⅠ三种酶对虫草属的18个菌种进行了鉴定分析。结果表明,18个虫草属菌株可以分为三类,一类为Cordyceps属;一类为Tolypocladium属;一类为Gibberella属。7.对102个黑木耳菌株的ITS区域进行了PCR扩增和限制性酶切片段长度多态性(RFLP)分析,选用HaeⅢ、MspⅠ、XbaⅠ和HpaⅠ四种酶对所有菌株进行了鉴定分类研究。ITS-RFLP研究结果表明,HaeⅢ、XbaⅠ和HpaⅠ可将黑木耳中混有的其他菌种区分开,而MspⅠ不能很好地将菌种进行区分;通过进一步测序比较,判定Au.a 0004、Au.a 0005、Au.a 0050、Au.a 0051、Au.a 0052、Au.a 0077菌株为毛木耳菌株;分子鉴定结果与栽培实验结果是一致的。然后,选用HaeⅢ、XbaⅠ和HpaⅠ三种酶对60株毛木耳菌株进行鉴定分类,发现Au.p 0038不是毛木耳菌株,而是黑木耳菌株。另外,HpaⅠ酶切黑木耳电泳结果与酶切分析结果不一致,通过进一步的酶切转化子、克隆测序,表明黑木耳rDNA核基因组内可能存在不同的ITS序列。