本文在回顾主流的企业资本结构理论的基础上，结合高科技企业特征，找出影响高科技企业资本结构的主导因素，并从理论上分析这些因素对高科技企业资本结构的作用。在实证上主要以我国高科技上市公司作为研究对象，选用沪、深市130家高科技上市公司，采用六年的数据，运用面板数据方法，从微观因素和宏观因素角度综合考察影响高科技上市公司资本结构的主导因素，并通过一个动态部分调整模型更加准确地分析这个问题。实证结果表明，与同期全部上市公司相比，高科技上市公司整体上存在着较低的资本结构。企业自身特征因素和宏观经济因素是高科技上市公司融资选择的重要影响因素。在动态模型中发现交易成本是影响高科技上市公司资本结构的重要因素。高科技企业应当从企业经营战略的角度来进行融资决策，结合自身特点设计合理的资本结构，并根据外部动态环境的变化进行调整。结合实证结果，对高科技企业的融资和公司治理问题提出合理化建议。