Pax3基因启动子区SNP及相关基因表达与鸭产肉性能的关系研究

来源 :四川农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:panok123
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卫星细胞作为肌肉胚后发育的干细胞,会直接影响肌肉的生长发育。Pax3和Pax7是卫星细胞的标志性基因,Pax3对于胚胎期动物的四肢正常地生长发育必不可少,而Pax7对肌肉的损伤修复有重要作用。它们对于肌肉的生长发育都很重要。农华肉鸭P系、建昌鸭、黑鹜鸭三个鸭品种在产肉性能上具有很大的差异,为了探讨Pax3及相关基因与这几个品种产肉性能间的关系,本研究通过扩增Pax3启动子序列并进行直接测序,筛选Pax3基因启动子区域是否存在影响产肉性能的SNP位点。同时,选择Pax3、Pax7、MyoD、MyoG为候选基因,检测它们在北京鸭、建昌鸭和黑鹜鸭三个品种腿肌中的表达差异。结果表明:1.扩增出鸭Pax3基因上游1271bp的启动子序列。生物信息学分析结果表明,鸭Pax3启动子区内存在典型的CAAT-Box、TATA-Box、G-Box、GATA-Box等结构域以及GATA-1、Sp-1和Myod转录结合位点,无CpG岛。2.通过对Pax3启动子片段的测序,共发现26个可能的SNP位点,但仅有5个SNP位点符合哈迪-温伯格定律(SNP1、SNP16、SNP19、SNP21和SNP24)。各SNP与三个鸭品种屠体性状的相关分析结果显示,农华肉鸭P系和黑鹜鸭中SNP1和SNP16的BB型个体的腹脂重、皮脂重和腿脂重高于AB型;在黑鹜鸭品种中SNP19的BB型个体腹脂重、皮脂重、腿脂重、腿肌重和胸肌重都高于AB型;建昌鸭和黑鹜鸭中SNP21的AB型个体腹脂重、皮脂重、腿脂重都高于BB型;建昌鸭SNP 24的AB型个体的腹脂重、皮脂重、腿脂重高于BB型,但以上差异均未达显著水平(P>0.05)。3.农华肉鸭P系腿肌中Pax3和Pax7的基因表达量显著高于建昌鸭和黑鹜鸭(P<0.05);MyoD基因表达量在黑鹜鸭腿肌中最高,建昌鸭和农华肉鸭P系依次降低,但差异不显著(P>0.05);MyoG基因在建昌鸭腿肌中的表达量显著高于农华肉鸭P系和黑鹜鸭(P<0.05)。不同品种腿肌中MyoG的表达量与腿肌重间不存在线性关系,表明MyoG的表达可能与肌肉的沉积无显著相关。4.在蛋白表达水平,Pax3和Pax7有相同的趋势,均是在农华肉鸭P系腿肌中最高,在黑鹜鸭腿肌中最低,但是差异不显著(P>0.05)。5.农华肉鸭P系腿肌中Pax3和Pax7在mRNA和蛋白水平的表达量均最高,表明Pax3和Pax7的表达可能是农华肉鸭P系相对建昌鸭和黑鹜鸭具有更高产肉量的原因之一。
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