化疗敏感型与化疗不敏感型三阴型乳腺癌患者血液circRNA差异表达分析

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目的:通过对化疗敏感型及化疗不敏感型三阴型乳腺癌患者血液circRNA高通量测序,筛选出表达差异显著的circRNA分子,寻找可能用于预测三阴型乳腺癌化疗疗效的circRNA分子,然后进行ceRNA分析及对预测的潜在下游mRNA进行KEGG分析,寻找可能与三阴型乳腺癌化疗敏感性相关的信号通路或目标基因。方法:乳腺肿块粗针穿刺活检确诊为三阴型乳腺癌且需新辅助化疗的患者,在治疗前留取清晨空腹血液标本,所用患者均采用TAC三周方案(T:多西他赛75mg/㎡,iv,d1;A:表柔比星75mg/㎡,iv,d1;C:环磷酰胺500mg/㎡,iv,d1)。在新辅助化疗过程中每周期化疗前对肿瘤进行多普勒超声评估,以B超测量的肿块最大横径与纵径的乘积变化评估患者每周期化疗疗效。按计划完成新辅助化疗后,采取手术治疗。根据术后病理结果及B超评估下肿块变化大小,筛选出化疗敏感型三阴型乳腺癌及化疗不敏感型三阴型乳腺癌患者。通过对化疗敏感型与化疗不敏感型患者的血液circRNA高通量测序,筛选出化疗敏感型乳腺癌患者与化疗不敏感型乳腺癌患者血液中表达差异显著的circRNA分子。采用实时定量PCR检测,寻找用于预测三阴型乳腺癌化疗效果的circRNA分子。进行ceRNA分析及对预测的潜在下游mRNA进行KEGG分析,寻找可能与三阴型乳腺癌化疗敏感性相关的信号通路或目标基因。结果:1.本文共对两组(化疗敏感型及化疗不敏感型)三阴型乳腺癌患者的血液标本进行circRNA基因芯片高通量筛选,共筛选出97个表达差异显著的circRNA分子(差异倍数≥1.5,P<0.05),其中表达上调组包含57个circRNA分子,表达下调组包含40个circRNA分子。通过实时定量PCR检测,发现hsacircRNA103762及hsacircRNA008817在化疗敏感型及化疗不敏感型三阴型乳腺癌患者血液中表达存在显著差异(P<0.05)。2.综合考虑差异倍数及P值,在表达上调组中选取5个circRNA进行ceRNA分析以及后续的KEGG分析,发现HLA-DMB、IL5、NFKBIB、ADRA1B、CACNA1S、P2RX2、SLC25A5、SLC26A6、TF、CSNK2B、RACK1、CTTN等基因参与的信号通路显著富集,其中HLA-DMB、IL5、NFKBIB位于辅助T细胞1(Th1)及辅助T细胞2(Th2)分化通路上。在表达下调组中选取4个circRNA进行ceRNA分析以及后续的KEGG分析,发现CYP3A5、HSD17B2、UGT2B10、UGT2B7、OR2G2、OR4C5、OR4C6、OR4X1、OR51T1、OR6C2、MT1HL1、MT2A、DYNC2H1、PFN3等基因参与的信号通路显著富集,其中CYP3A5、HSD17B2、UGT2B10、UGT2B7位于类固醇激素生物合成通路上。结论:1.hsacircRNA103762和hsacircRNA008817可能作为三阴型乳腺癌化疗敏感性的血液标志物。2.HSD17B2基因及其所在的类固醇激素生物合成通路和POLD2基因可能与三阴型乳腺癌化疗敏感性有关。
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