2009-2011年甘肃省和陕西省流行的人副流感病毒1、2、3型基因特征分析

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cmudh134
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:研究我国甘肃省、陕西省流行的人副流感病毒(Human Parainfluenza viruse, HPIVs)的基因特征和流行规律,为中国大陆人副流感病毒分子流行病学研究累积数据。方法:2009年1月至2011年12月共采集甘肃省和陕西省因急性呼吸道感染的住院患者的咽拭子标本719份,采用多重反转录聚合酶链反应(Multiplex reverse transcription polymerase chain reaction,多重RT-PCR)方法对常见呼吸道病毒性病原体进行筛查。多重RT-PCR筛查HPIVs阳性的标本用巢式PCR (nested polymerase chain reaction, nested PCR)扩增其血凝素-神经氨酸酶蛋白(Hemagglutinin-neuraminidase, HN)基因,扩增产物采用全自动核酸分析仪进行分析,HN阳性样本进行序列测定和基因分析。根据序列测定结果进行核苷酸和氨基酸(Amino acid, AA)同源性分析,应用比邻法(Neighbor-Joining Tree)建立HPIVHN基因系统进化树。结果:经多重PCR筛选出67份感染HPIVs的样本,其中39份为HPIVs与其它呼吸道病毒混合感染的样本。巢式PCR和序列测定分析共得到HPIVs HN蛋白基因全长序列17条,其中HPIV-12条、HPIV-22条和HPIV-313条。2株HPIV-1均属于B群,其核甘酸和氨基酸的同源性分别为99.2%和100%;与17株日本代表毒株的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.3%-98.8%和96.5-99.7%,其中分别与AB641251/Yamagata/07/2072、AB641301/Yamagata/2145/09的核苷酸同源性最大,分别为98.8%、98.8%、98.7%,和98.7%,但是氨基酸同源性皆为100%。2株HPIV-2(?)中gansu11-62110396属A群、gansu11-s191属于B群,2株HPIV-2的HN全基因序列的核苷睃和氨基酸同源性分别为92.5%和94.3%;与18株HPIV-2代表毒株的核苷酸和氨基酸同源性分别为91.7%-98.4%和94.2%-98.4%。Gansul1-62110396与Oklahoma/94/USA/09的核苷酸和氦基酸同源性最大,分别为97.6%和98.4%,而gansu11-s191则与日本分离株4-80/04的核苷酸同源性最大,为98.4%,但氨基酸同源性仪为97.7%。13株HPIV-3均属C3亚群,其核苷酸和氦基酸同源性分别为97.8%-99.8%和98.9%-100%;与美国、加拿大和澳大利亚的HPIV-3的HN基因序列之间的核苷酸和氨基酸同源性较小,最小分别为94.0%和96.6%。Shaanxi09-2与shaanxi10-H0091、shaanxi10-H0091与gansu11-62110372以及shaanxi09-2与BJ/291/09之间的核苷酸同源性分别为99.4%、99.3%和99.4%,但是其氨基酸同源性均为100%。结论:2009-2011年甘肃省和陕西省的HPIVs流行毒株以HPIV-3株为主,均属C3亚群,提示甘肃和陕西两省不同年份间存在HPIV-3的持续循环传播;并且和日本的HPIVs毒株的核苷酸和氨基酸同源性比较高,提示HPIVs的流行毒株存在一定的地域局限性。HPIV-1株和HPIV-2株仅在甘肃省散在发病。
其他文献
目的分析老年人哮喘的临床特点及诊治情况。方法回顾分析我院2007年1月—2008年12月60例老年哮喘患者的临床资料。结果老年患者病程长,诱因多以呼吸道感染为常见。中、重度发
<正>一、成语导入,巧妙铺垫1.同学们,我们先来看一组词,(出示:勇往直前毫不示弱百折不挠宁折不弯)谁来读一读?(生读)2.这些词都表示什么?3.从这些词我们感受到,面对困难,我们
支气管败血波氏杆菌(Bordetella bronchiseptica,Bb)是一种重要的病原菌,广泛感染包括猪、犬等家畜,兔、豚鼠等实验动物,雪貂、考拉熊及栗鼠等野生动物在内的多种哺乳动物,并
<正>早在南北朝时期,刘勰通过《文心雕龙·知音》强调指出:"夫缀文者情动而辞发,观文者披文以入情,沿波讨源,虽幽必显。"从中不难看出,无论"缀文者"还是"观文者",都应当而且
目的:探究乳腺癌转移抑制基因1(breast cancer metastasis suppressor 1,BRMS1)抗肾细胞癌作用的具体机制。方法:构建BRMS1过表达以及表达敲低的稳定转染细胞系,检测BRMS1过
西方世界警察制度一般分为两种类型:一种是以法国为代表的欧洲大陆警察制度,强调集中统一的领导和管理,实行国家警察与国家宪兵两种并行的警察模式,属于中央集权的警察制度;
随着科学技术的进步,人民生活水平的提高,用电客户的规模也在不断扩大,传统手工抄表的工作量越来越大,同时,传统手工抄表方式常出现误差,极大地影响电力公司的经济效益。本课题的主
随着经济的不断发展,并购已经成为企业快速获得资源、扩大规模、增强竞争优势的投资选择趋势。并购后的战略整合是决定并购成功与否的关键。对企业并购后可能出现的问题进行
以郑州城市创业为分析案例,对城市创业因素、城市创业理念、城市创业问题等相关内容做出初步探讨,并提出城市创业的若干思路和对策,从而加深了对城市创业概念和城市创业战略
歧口18-1油田生产井出现严重结垢现象。通过分析电潜泵表面垢样组分,判断该生产井结垢原因,针对性开发出适用于该油田的阻垢剂TS-6611。对其阻碳酸钙垢、硫酸钙垢、硫酸钡(锶)垢