肿瘤相关基因CLDND1表达产物的分析与检测

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目的:利用生物信息学分析假想蛋白 CLDND1结构组成,预测其结构及功能;通过制备融合蛋白CLDND1多克隆抗体,在CLDND1 mRNAs高表达的肿瘤细胞及组织中进行定性及定量检测,期望为CLDND1基因的进一步研究奠定基础。  方法:利用Northern blot技术分析CLDND1基因的mRNA在人不同组织器官表达特异性。生物信息学分析预测CLDND1蛋白结构组成、保守性、亲水性、免疫原性等理化特性,RT-PCR体外扩增 CLDND1编码框序列,将扩增到的目的基因片段插入到原核表达载体 pET-32a相应酶切位点,构建重组表达质粒pET-32a-CLDND1,验证重组成功后,将阳性重组质粒转化至 E.coli BL21菌株,IPTG诱导蛋白表达,用融合蛋白对新西兰大白兔进行免疫,收集并纯化抗血清,获得纯度较高的多克隆抗体,ELISA测定抗体效价,Western blot检测抗体特异性并进行内源蛋白检测,利用获得的抗体通过免疫共沉淀纯化目标蛋白并送测序。  结果:  (1)Northern blot技术检测CLDND1的mRNA表达水平在正常的神经组织中高表达,在其他的正常器官组织中不表达或低表达,而在多种肿瘤细胞中也呈现高表达的趋势;  (2)生物信息学分析显示该蛋白有四个跨膜结构域,发现该段序列与大鼠、小鼠同源性高达93%,第28-138个氨基酸(Aa)处免疫原性较好,较适合制备抗体;  (3)成功构建重组原核表达质粒pET-32a-CLDND1(28-138 Aa),并表达出约35 kDa的带标签的融合蛋白;  (4)制备出了CLDND1蛋白的多克隆抗体,ELISA测定CLDND1蛋白的多克隆抗体效价在1︰128000,Western blot检测抗体特异性较好;  (5)Western blot检测到预计目的条带的存在,但有多带现象;  (6)蛋白样品 SDS-PAGE切胶质谱鉴定和免疫共沉淀后质谱鉴定均未获得与CLDND1预测蛋白序列相符合的蛋白质。  结论:制备出兔抗人CLDND1蛋白的多克隆抗体,蛋白检测结果未发现CLDND1蛋白质表达产物,CLDND1是否为一个编码产生蛋白质的基因有待进一步研究。
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