大量的非编码RNA(nc RNA)序列存在于人类基因组序列,长链非编码RNA(lnc RNA)是一类非编码RNA,对人体生理调控过程密切相关,此外还在很多疾病的发生和愈后过程中起到很重要的作用,是近年来的研究热点。近些年,得益于高通量测序技术的快速发展,越来越多的lnc RNA序列被发现,因此新lnc RNA的发现和其功能研究,是我们关注的重点。lnc RNA-seq是利用高通量测序手段发现新的lnc RNA的有效工具,基于参考序列的组装有助于我们发现更多特异的novel lnc RNA转录本,在测序完成后基于reads比对的定量分析更加精确,在基础研究、临床诊断和药物研发等领域都有一定应用。目前,在多个研究领域都已经开展了lnc RNA-Seq高通量测序并得到了大量的数据和实验结论。然而,辐射应答的lnc RNA目前研究刚处于起步阶段,至今鲜有报道,所以我们将研究中重点聚焦于辐射应答的lnc RNA。本论文实验依托于兰州重离子加速器-冷却储存环和Faxitron 650 X射线辐照平台,利用lnc RNA-Seq深度测序技术,发现和研究重离子和X射线辐射应答的lnc RNA。测序结果采用生物信息学的方法进行数据分析和筛选得出大量与电离辐射应答相关的lnc RNA。根据得到的lnc RNA转录本序列设计引物,进行不同剂量和时间的表达水平验证实验。为了探究lnc RNA表达的保守性与剂量效应,实验采用不同剂量的X射线和不同辐射品质的重离子选取不同的时间点在不同的人肿瘤细胞系和正常细胞系中进行lnc RNA的表达研究。结果显示有大量的lnc RNA对电离辐射有应答效应,并且在不同的细胞系和辐照环境下都具有明显的应答效应。最终发现1028种lnc RNA的转录水平发生了改变,其中包括381种新lnc RNA。本研究首次开展了电离辐射应答机制方面的lnc RNA研究,并获得了大量lnc RNA转录本数据,不仅找出了参与电离辐射应答了关键lnc RNA还为后续的研究提供了思路。