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目的麻疹是一种世界性分布的、主要感染儿童的急性、高度传染性的疾病。尽管在过去40多年具备了完全和有效的疫苗,但是麻疹仍是造成发展中国家儿童死亡的重要原因。2004年（具有统计数字的最近年份）全球有454000人死于麻疹,其中多数是儿童。WTO认为,通过核查麻疹病毒的基因型,可以判断新发病例是否预示新的流行。因此,对于麻疹病毒的分子流行病学监测研究,是麻疹控制工作中实验室方面最重要的任务之一。本课题通过对昆明地区麻疹病毒的基因型和分子流行病学研究,了解本研究中麻疹病毒的变异情况,以及与麻疹患者临床表现的相关性,为麻疹监测和防治提供依据。方法采集38例麻疹患儿急性传染期静脉血2ml,应用酶联免疫吸附试验（Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA）检测麻疹病毒血清IgM抗体;同时收集其中30份麻疹患儿的尿液标本,运用逆转录—聚合酶链反应（ReverseTranscription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR）对尿液标本中所分离到的麻疹野病毒株的核蛋白（N）基因羧基末端的516个核苷酸进行双向扩增,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并与麻疹病毒基因库中的参考株进行比较,然后以核蛋白基因羧基末端的543个核苷酸片段构建基因亲缘性关系树,进行核苷酸、氨基酸同源性分析。同时收集麻疹患儿的临床流行病资料,进行临床流行病学分析。结果1.38例麻疹患儿的血清麻疹IgM抗体均为阳性,阳性率100%。从30份麻疹患儿尿液标本中分离到7株麻疹野病毒,阳性检出率为23.33%。麻疹患儿出疹后6天的尿液标本中仍可检出麻疹病毒。2.从分离到的7株麻疹野病毒株中随机选取4株,对这4株麻疹野病毒的核蛋白（N）羧基末端的516个核苷酸进行序列测定和分析,并与Genebank中的麻疹病毒的23个参考株进行基因亲缘性关系比较,证实该4株麻疹野病毒均为H基因型。3.将所分离到的4株麻疹野病毒N基因羧基末端的543个核苷酸序列与WHO中国流行的H1型参考株China93-7、H1a型参考株China93-2、H1b型参考株China94-7、H2型参考株China94-1的对应序列做基因亲缘性关系分析,分别构建核苷酸序列亲缘关系树和氨基酸序列亲缘关系树,所分离到的昆明地区麻疹野病毒均为H1a基因型。4.4株麻疹病毒核苷酸序列与WHO的H1、H2基因型参考株China93-7、China94-1所对应的核苷酸序列的遗传距离分别为0.031～0.047和0.332～0.398,而与H1a的遗传距离为0.010～0.033。4株麻疹野病毒组内核苷酸遗传距离为0.005～0.040。与WHO的H1、H2基因型参考株China93-7、China94-1所对应的氨基酸序列的遗传距离分别为0.088～0.149和0.205～0.282,而与H1a的遗传距离为0.003～0.066。4株麻疹野病毒组内氨基酸遗传距离为0.010～0.073。说明昆明地区的麻疹野病毒株主要为H1a基因型。5.4株麻疹野病毒N基因羧基末端543个核苷酸的同源性为96%～98.9%,核苷酸的差异为6～22个碱基;氨基酸的同源性为95.6%～99.6%。与H1标准株China93—7的核苷酸同源性为95.9%～99.7%,氨基酸同源性为89.9%～94.8%。与H1a标准株China93—2的核苷酸同源性为96.9%～99.8%,氨基酸同源性为94.8%～99.7%。6.本次研究中,麻疹患儿最小年龄为51天,最大11岁,≤2岁的患儿共30人,占本次研究总病人数的78.95%。说明麻疹高发年龄是≤2岁的婴幼儿;男女患儿的比例为1.53:1,男性患儿多于女性患儿。7.从麻疹患儿尿液标本中分离到的7株麻疹野病毒株中随机选取4株,进行序列测定和分析表明均为H1a基因型,但这4名患儿的临床表现差异很大（见表8）,表明麻疹患儿的临床表现和麻疹病毒的基因型无明显相关性。8.本次研究中的麻疹患儿均为散发病例,未发现爆发流行的病例。所收集的病例中昆明市区以五华区和西山区病例最多,周边地区以禄劝患者病例数最多,病人数均为7例。9.38例麻疹患儿中,未免疫和免疫史不祥的病例数占总病人数的81.58%。结论1.目前昆明地区流行的麻疹病毒优势基因型为H1a基因型,与云南省2005年的本土流行株基因型一致,未发现有明显的核苷酸和氨基酸变异。未检测到H1b和H2基因型。2.患儿的临床表现与麻疹病毒的基因型无明显相关性。3.麻疹患儿的年龄跨度大,但以≤2岁的婴幼儿为主,且以未接种过麻疹疫苗的患儿居多。