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日本沼虾（Macrobrachium nipponense），是在我国广泛分布的淡水经济虾类，也是我国重要的淡水养殖虾类。但随着养殖规模的不断扩大，日本沼虾种质已出现明显退化，严重制约了虾类养殖业的健康发展，迫切需要对日本沼虾进行资源保护和遗传改良。对日本沼虾各地方种群以及近缘种进行遗传背景调查，研究其遗传分化情况，则是资源保护和遗传改良的基础。 本文采用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对6个地理种群（微山湖、洪泽湖、太湖、龙感湖、洪湖、珠江）的日本沼虾各30个个体进行了遗传多样性分析。在事先优化的反应条件下，所使用的OPI、OPM、OPP、OPX四个系列80个随机引物中，筛选出能扩增出清晰稳定片段的引物20个，除OPX-08为单态引物外，其余均为多态引物，多态引物比例为95％。共检测到220个位点，大小在100～2000bp之间。保守位点89个，在扩增结果中保持恒定，是日本沼虾的特征条带。多态位点131个，多态位点比例59.55％；各群体的多态位点数为34～78不等，多态位点比例为18.38％～40.00％。日本沼虾平均遗传杂合度为0.2671，各种群平均遗传杂合度为0.1485～0.2024。Shannon信息指数（H0）为0.2174～0.2901。日本沼虾6个地理群体的两两地理群体间遗传分化指数Gst值在0.1655～0.4483之间，群体间总的遗传分化指数Gst0值为0.4461，说明日本沼虾地理群体之间已经发生了中等或大的分化。6个地理群体间Nm值在0.6154～2.5210之间，也表明日本沼虾群体间已经发生显著或重要分化。遗传距离为0.1444～0.0336，日本沼虾群体之间的遗传距离与地理距离密切相关。本文从DNA水平研究了日本沼虾遗传多样性，不仅可为日本沼虾的种质资源保护和合理开发利用提供依据，而且可为日本沼虾遗传改良和育种素材的选择提供参考。 运用人工授精方法，进行海南沼虾（♀）×日本沼虾（（?））杂交试验，获得了可育的F1代杂种，并对F1代及其双亲进行了RAPD分析。共进行6批杂交试验，4批抱卵，3批获得杂交虾，成活率分别为30％，48％，64％。形态上，F1杂种兼有双亲特征，但偏向父本。RAPD扩增结果显示，海南沼虾和日本沼虾的扩增带型存在显著差异，F1杂种兼有双亲的特征带。海南沼虾和日本沼虾之间的遗传距离为0.7856，父本日本沼虾与F1杂种的遗传距离为0.4109，母本海南沼虾与F1杂种的遗传距离为