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本研究利用PCR-RFLP和PCR-SSCP技术研究了郏县红牛、秦川牛和南阳牛共计311个个体POU1F1基因Exon6的HinfI、AluI和PstI基因座,LPL基因Exon1、Exon2、Exon3和Exon4基因座共计7个基因座多态性,并对这些基因的多态性与黄牛体重、体尺性状的关系做了分析和探讨,旨在获得相应的分子遗传学信息,找到经济性状的分子标记,为中国牛种遗传资源的保护与利用、分子标记辅助育种的开展和黄牛生产性能的提高提供科学依据。所获得结果如下:1.POU1F1基因第6外显子多态及其与郏县红牛生长发育性状的关系451bp的POU1F1基因片段被HinfI酶切后表现多态,AA/AB/BB基因型的频率分别为0.1875/0.3056/0.5069,A/B等位基因频率分别为0.3403/0.6597,该基因座处于非Hardy-Weinberg平衡状态。该位点纯合度度为0.5510,杂合度为0.4490,有效等位基因数为1.8148,多态信息含量为0.3482,属中度多态,可作为该群体遗传资源评价的建议性指标。然而,郏县红牛POU1F1基因AluI和PstI基因座均未检测到多态性,仅发现AA基因型,表明这些基因座比较保守。HinfI多态性与郏县红牛生长发育性状的相关分析表明,在体长指标上BB基因型显著高于AB基因型个体(P＜0.05),提示B等位基因可能对体长性状有显著影响;然而不同基因型与郏县红牛胸围、十字部高、体重等指标上均无显著差异(P＞0.05)。因此BB基因型可作为郏县红牛体长性状标记辅助选择的DNA标记。2.LPL基因多态及其与秦川牛生长发育性状的关系经PCR-SSCP检测,秦川牛LPL基因Exon2、Exon5表现多态,而Exon1、Exon3基因座未发现多态。(1)在LPL-Exon2基因座上,秦川牛群体表现3种基因型(AA、AB、BB),A/B等位基因频率分别为0.6855/0.3145,该基因座处于Hardy-Weinberg平衡状态,相关分析表明,该基因座各基因型对体尺性状均无显著影响(P＞0.05)。(2)在LPL-Exon5基因座上,A/B等位基因频率分别为0.3226/0.6774,多态信息含量为0.3415,属于中度多态,该群体在此基因座上处于Hardy-Weinberg平衡状态。相关分析表明,在体高、十字部高、体斜长、胸围、尻长和体重指标上,AB基因型显著高于AA和BB基因型(P＜0.05),杂合子具有明显优势。3.LPL基因多态及其与南阳牛生长发育性状的关系对南阳牛LPL基因4个基因座的PCR-SSCP检测结果表明,Exon2、Exon5基因座表现多态,而Exon1、Exon3基因座未发现多态。(1)在LPL-Exon2基因座,由一对等位基因A、B控制,等位基因频率分别为0.7095和0.2905,位点杂合度为0.4122,多态信息含量为0.3272,该基因座处于Hardy-Weinberg平衡状态。不同基因型与生长性状指标相关分析的表明:基因型AB对初生体重影响显著(P＜0.05),并影响18月龄的体高。(2)在LPL-Exon5基因座,多态性表现为AA、AB和BB 3种基因型。南阳牛群体位点杂合度为0.4638,多态信息含量为0.3562,该基因座处于Hardy-Weinberg平衡状态。南阳牛群体内AB基因型个体在各项体重及体尺指标上均高于群体的AA型个体,但差异都未达到显著水平,仅在初生重指标上AB基因型显著高于两纯合基因型(P＜0.05)。