铁水联运作为当今国际社会上多式联运中重要组成部分,凭借大运量、低能耗及受恶劣天气影响小等综合优势,早已在世界范围内得到广泛认可。然而在我国,由于铁水联运实行多头管理,导致运作效率低下、服务水平欠缺、市场份额偏低等一系列问题。本文以大部制改革为背景,从管理层面出发,基于一体化管理理念,旨在完善铁水联运一体化管理体系。本文以我国铁水联运发展历程为起点,结合近年市场效益、发展状况、政策体制等方面,从系统结构内部与外部的多个角度对其进行系统分析,再对各个子系统从多方面进行问题分析；接着从管理层面分别对政策法规与监管机制、港站运营管理模式、信息平台、资助与优惠政策四大方面的国内外成功运作实践进行比对借鉴,取其所长、避其所短；同时分析大部制改革对政府、综合交通体系以及铁水联运的意义,并基于改革后的体制优势进行铁水联运一体化管理内涵分析,让铁水联运作为一个整体协调运作,局部之间相互协调,相互促进,相互补充,相互强化,凝聚成强大的组织力,再对铁水联运在大部制下进行一体化管理的迫切性、必然性与可行性进行分析；最后提出方案解决对策,一是建立健全铁水联运一体化管理机制,建立多部门联合监管机构,健全政策制度管理机制,加强执行监管力度,加强宣传与人才培养工作；二是创新铁水联运港站管理模式,联合铁水联运运营人、铁路企业、港口企业、航运企业以及运输链上的其他物流企业等多个经济实体,基于动态物流联盟关系以股份制形式组建联盟体；三是推动铁水联运信息一体化建设,联合铁水联运链上各个部门企业,构建铁水联运信息交换平台,并对信息平台进行逻辑框架和数据库框架设计；四是深化铁水联运运价机制与资助优惠政策改革,制定我国铁水联运运价管理机制,提出多项定价改革与资助补贴策略。