环境生物信息系统是从污染生态学和环境污染修复角度出发建立的数据库管理系统，它不仅兼容植物、动物、微生物数据库的建立和使用，而且将信息领域拓展到环境科学。它与以往开发的生物数据库相比具有以下优点：1、应用范围广。植物、动物、微生物方面的信息均可在软件支持下建成数据库并使用。用户根据不同目标可建立各种各样的数据库，如：超富集植物数据库、濒危动物数据库、环境微生物数据库等等。2、信息扩充功能强大。软件具有完备的表设计、数据录入功能，且操作简单。普通用户就可实现生物信息的扩充，不需要专业人员帮忙。3、软件使用简单。代码与实体间的自动转换，辅助输入，下拉式列表框提示等功能为用户提供了快捷、可靠、周到的服务，使软件摆脱了专业性质，成为像MicrosoftOffice一样大众化的软件。4、查询信息便利。软件把复杂难懂的查询语言可视化，条件生成器能帮助用户快速生成正确的查询条件语句。 　　目前，环境生物信息系统中已建成的数据库有：863红树林滩涂海水种植—养殖系统数据库(863数据库)，中国高等植物数据库(植物数据库)及其它小型数据库。 　　1、863数据库包括：养殖塘、红树植物、水产品、水体、土壤、底泥、凋落物、藻类、微生物、经济评价等方面的信息和数据。用户通过软件可查询任何监测时段内的所有监测指标变化，全面掌握系统长期的物质动态，如：红树植物生长曲线、水质变化曲线、微生物种群动态、凋落物分解曲线、经济指标等信息。软件还可对比不同密度下的红树植物养殖塘与无红树植物养殖塘的各种指标，筛选符合不同目标的红树植物作为推广。2、植物数据库包括8358种中国常见的高等植物的种名、拉丁名、科名、属名、高、生长环境、用途、产地、植物图、对污染物抗性等信息。3、其它小型数据库有：濒危动物数据库、环境微生物数据库等。