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旱黄瓜是冀东优势特色产业之一,单性结实性是黄瓜与产量和品质有关的重要经济性状。本文利用SSR标记分析了38份旱黄瓜种质资源的亲缘关系,基于旱黄瓜强单性结实自交系‘6457’和非单性结实自交系‘6429’,采用植物数量性状主基因+多基因混合遗传分析方法,对黄瓜单性结实性进行了六家系世代(P1、P2、F1、B1:2、B2:2、F2:3)联合分析,并利用‘6457’ב6429’的F2群体对单性结实性进行了QTL定位。1.利用黄瓜全基因组测序的450对SSR引物对38份旱黄瓜材料进行聚类分析表明:72对引物扩增出133个等位变异;38份旱黄瓜材料相异系数分布在0.215~0.704之间;‘6457’与‘佳美旱黄瓜’、‘选丰’与‘佳美旱黄瓜’、‘新宝’与‘绿之秋’亲缘关系较远,而‘gfcs’与‘四季翠绿’、‘玉翡翠’与‘翠玉’、‘真把握’与‘唐山秋瓜’、‘真把握’与‘皇家绿秀’亲缘关系较近;阈值为0.54时,38份黄瓜材料划分为Ⅰ、Ⅱ类。阈值为0.48时,Ⅰ类可再分为ⅠA、ⅠB、ⅠC、ⅠD 4个亚类,Ⅱ类可再分为ⅡA、ⅡB、ⅡC 3个亚类。2.对‘6457’与‘6429’杂交组合6家系世代群体的单性结实性遗传分析表明,黄瓜的单性结实性表现为不完全显性遗传,符合D-0遗传模型,受1对加性-显性主基因+加性-显性-上位性多基因控制。主基因的加性效应值和显性效应值分别为10.31和7.73。B1:2、B2:2、F2:3的主基因遗传率分别为1.44%、39.65%、24.62%,B1:2、B2:2、F2:3的多基因遗传率分别为53.31%、0.00%、35.21%。3.利用‘6457’和‘6429’两亲本筛选AFLP、SRAP、SSR、ISSR、RAPD引物各256对、693对、312对、77条、365条,分别获得27对、97对、52对、12条、26条多态性引物,之后检测该标记在F2群体单株的基因型,用Map Maker 3.0软件构建遗传连锁图谱,包含5个连锁群;48个AFLP标记,37个SRAP标记,6个SSR标记,8个ISSR标记和8个RAPD标记;覆盖基因组556.1 cM,平均图距为5.2 cM。利用Windows QTL CartographerV 2.5软件复合区间作图法对单性结实性进行QTL定位,检测到2个与黄瓜单性结实性相关的QTL位点,其中par 1.1位于LG1的E37M69-2与E41M47-1标记之间,LOD 15.6,解释31.6%的表型变异;par 2.1位于LG2的ME9GA18-2与SSR03084标记之间,LOD 4.9,解释12.7%的表型变异。