青藏高原地形地貌复杂、气候条件多样,因此该地区不仅拥有丰富的物种种类,而且还包含大量的特有物种。然而,青藏高原上大部分特有物种都是近期起源,只有一小部分特有物种分化较早。针对这些在青藏高原隆升早期分化的物种开展群体演化历史研究,有助于了解青藏高原隆升和气候变化对物种的起源和演化的影响。因此,本文以青藏高原特有物种小子圆柏(Juniperus microsperma)及其五个近缘物种(包括圆柏(J. sabind)、中亚圆柏(J.semiglobosa)、密枝圆柏(J. convallium)、西藏圆柏(J. tibetica)和方枝柏(J.saltuaria))的51个居群、239个个体为研究对象,利用8套核基因分子标记和2套叶绿体分子标记,调查其群体遗传结构、物种形成和种群演化历史。野外调查发现小子圆柏仅分布在帕隆藏布江沿岸极小区域,与密枝圆柏、西藏圆柏和方枝柏同域或邻域分布,与圆柏和中亚圆柏异域分布。分子系统发育关系和群体遗传学数据分析表明,小子圆柏与圆柏、中亚圆柏聚为一支(后两种亲缘关系更近),密枝圆柏、方枝柏和西藏圆柏聚为另一支。隔离迁移模型表明,小子圆柏与其姊妹类群(圆柏和中亚圆柏)在中新世早期经历异域分化,在时间尺度上与青藏高原早期隆升事件吻合。种群动态模型模拟结果表明,在第四纪全球气候发生强烈波动期间,小子圆柏经历了一次明显的瓶颈事件。总之,青藏高原隆升和第四纪冰期气候变化深刻塑造了青藏高原特有物种小子圆柏的物种形成和种群演化历史。