氧化应激诱导小鼠海马神经元microRNA表达谱的改变及验证

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目的:随着科技和经济的发展,现代社会人口老龄化趋势迅速增长,老年性痴呆(Alzheimer’s Disease, AD)的患病率逐年上升,严重影响老年人的生存质量。AD是最常见的一种神经退行性疾病,以进行性认知功能障碍为特征,主要病理改变为皮质神经元数量减少、神经纤维缠结(neurofibrillary tangle, NFT)和含有β-淀粉样肽(β-amyloid peptide,Aβ)的老年斑(senile plaque, SP)的形成以及部分脑区(海马、新皮质和基底前脑等)神经突出消失等。AD的病因复杂,一般认为由基因突变、老化、外伤等多种因素引起,目前尚无有效的治疗方法,给个人、家庭和社会带来沉重的负担。关于AD的发病机制存在多种学说,包括氧化应激学说、基因突变学说、Aβ级联学说、Tau蛋白假说、线粒体功能障碍和自噬等,其中氧化应激学说备受关注。大量研究证实氧化应激最早参与了AD的病理进程。MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约22个核苷酸的内源性非编码小RNA,通过抑制mRNA的转录后翻译调控蛋白的表达。大量研究表明,miRNAs在脑老化及神经退行性疾病的发生、发展过程中发挥重要作用。但在氧化应激致AD发病早期,miRNAs表达的改变及其对靶分子的调控机制尚不清楚。H2O2是一种稳定的活性氧自由基。本研究以H2O2刺激原代培养的海马神经元制备氧化应激细胞模型,检测氧化应激诱导的miRNAs表达谱的改变。对差异性表达miRNAs进行Real-time PCR验证,并对其靶基因进行生物信息学分析,筛选可能与氧化应激致AD发生有关的miRNAs。为进一步研究miRNAs在AD发病中的作用和调控机制以及开发以miRNAs为靶点的相关药物提供依据。方法:(1)实验动物:封闭群清洁级健康快速老化模型小白鼠(SenescenceAccelerated Mouse, SAM)。(2)实验方法:①海马神经元分离培养:选择孕18-19天的SAMR1小鼠,取出完整的胎鼠海马组织进行分离培养,以5×108cells/L接种至直径35mm的培养皿中(2ml/dish),用于提取RNA进行基因芯片筛选及Real-time PCR验证;以5×107cells/L接种于96孔板中(200μl/孔),用于测定细胞活力;以1×108cells/L接种于24孔板中(1ml/孔),用于测定细胞凋亡、坏死。②海马神经元的鉴定:对生长到第7天的海马神经元进行特异性标志物微管相关蛋白2(Microtubule-associated protein2, MAP-2)免疫荧光染色,鉴定海马神经元。③MTT法测定细胞活力:将生长7天的海马神经元随机分为5组,每组中分别加入0、100μM、200μM、400μM、800μM的H2O2处理24h,用MTT法测定细胞活力,观察细胞损伤情况,选择合适的H2O2刺激浓度。④采用TUNEL和PI染色测定细胞凋亡、坏死:将生长了7天的海马神经细胞随机分为2组,其中一组加入正常neurobasel培养液,另一组加入含200μM H2O2的neurobasel培养液,24h后用TUNEL和PI染色法测定细胞凋亡、坏死。⑤提取细胞总RNA进行miRNAs基因芯片筛查:应用Qiagen公司的MiRNeasy Mini Kit试剂盒提取正常培养和200μMH2O2刺激6h后的海马神经元总RNA,Nandrop ND-1000分光光度计测定RNA质量,1%琼脂糖凝胶电泳测定RNA纯度,采用Affymetrix miRNA基因表达谱芯片GeneChip miRNA2.0Array进行杂交,检测海马神经元miRNAs的表达谱。⑥miRNAs生物信息学分析:根据基因芯片结果,筛选出倍数变化在1.5倍以上的miRNAs,应用DAVID软件对miRNAs的靶基因进行生物信息学分析。⑦筛选与AD发病有关的miRNAs采用Real-time PCR方法进行验证。⑧统计学方法:所有数据采用x±s表示。用SPSS13.0软件进行数据处理,采用方差分析和独立样本t检验进行统计学分析,以P <0.05为有统计学意义。结果:(1)海马神经元鉴定:微管相关蛋白MAP-2荧光染色,阳性反应物呈绿色荧光,反应物分布于神经元的胞体与树突,轴突和神经胶质细胞均不显色。染色结果显示,培养至第7天的海马神经元胞体饱满,呈椭圆形或多边形,树突发达,相互交错,形成发达的神经纤维网络。(2)细胞活力测定:MTT结果显示,不同浓度的H2O2刺激海马神经元,细胞活力明显降低(P <0.01),并且表现出剂量依赖性。(3)TUNEL染色测定细胞凋亡:与正常培养的海马神经元比较,200μM H2O2刺激24h后细胞凋亡明显增多(P <0.01)。(4)PI染色测定细胞坏死:与正常培养的海马神经元比较,200μM H2O2刺激24h后细胞坏死明显增多(P <0.01)。(5)miRNAs芯片结果:与正常对照组相比,H2O2刺激组有101个差异表达的miRNAs(P <0.05),其中17个变化在1.5倍之上。mmu-mir-26b、mmu-mir-296、hsa-mir-9-1、mmu-mir-369、hsa-mir-200c、mmu-mir-32、mmu-mir-1965、hsa-mir-708、mmu-mir-1190、hsa-mir-377、mmu-mir-135b、mmu-mir-201,12个miRNAs在H2O2刺激后的海马神经细胞表达明显上调;mmu-mir-470、mmu-mir-713、mmu-mir-297c、mmu-mir-190b、mmu-mir-291a,5个miRNAs在H2O2刺激后的海马神经细胞表达明显下调。(6)生物信息学分析结果显示:这些差异性表达的miRNAs参与了细胞增殖、分化、凋亡、神经营养因子转运、信号传递、癌症生成等多个生物学过程,其中5个miRNAs(miR-708、miR-296、miR-200c、miR-377、miR-1190)的74个靶基因参与了丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated protein kinase, MAPK)信号通路的激活。(7)差异性表达miRNAs的验证:综合考虑芯片结果、AD的病理变化及参考文献中miRNAs在海马组织中的表达量,筛选出miR-32、miR-196b、miR-26b、miR-708、miR-135b进行Real-time PCR验证。结果显示,miR-135b、miR-708在H2O2刺激组的表达量较正常组明显升高,与芯片结果一致。(8)对miR-135和miR-708进行GO分析,结果显示:miR-135的靶基因主要参与了DNA重组、蛋白泛素化、蛋白磷酸化和转录因子结合等多种生物学过程的调控;miR-708的靶基因主要参与了小GTP酶活性、蛋白磷酸化、细胞增殖和神经元发育等过程的调控。结论:(1)H2O2刺激可引起神经元细胞活力明显下降、细胞凋亡与坏死明显增加,提示氧化应激引起细胞凋亡可能是AD发病的主要机制之一。(2)氧化应激可引起小鼠海马神经元miRNA表达谱的明显改变,提示差异性表达的miRNAs可能参与了氧化应激致AD发病的分子机制。(3)生物信息学分析结果提示氧化应激状态下,miRNAs可能通过MAPK信号通路影响蛋白的泛素化和磷酸化,参与AD病理过程的形成。
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