正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库的构建和EST的初步分析

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淋巴细胞是具有特异性免疫功能的免疫活性细胞,它们在免疫应答过程中起着核心作用,是构成机体防御系统的重要组成部分。 本研究用经典文库构建技术,构建了正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库,得到了库容量为1.2×10~6pfu/ml、重组率为94%、85%的插入片段处于750bp~2000之间的高质量文库。随机测定了1100条ESTs,经拼接和聚类,得到了152条高表达基因Contigs和619条低表达基因Singletons。其中高表达基因主要包括:血色素α亚基、rRNA核酸内切酶、衰老相关蛋白、促进增殖基因21、细胞色素氧化酶Ⅲ和血色素β亚基。经序列比对后发现,有23%的ESTs为与任何物种都没有匹配的新基因,有75.9%的ESTs为与猪没有匹配的猪的新基因,说明了大部分的猪外周血淋巴细胞的基因还没有被分离和鉴定出来。经GO进行功能基因的分类和KEGG进行路径图的绘制,初步绘制了正常猪外周血淋巴细胞的基因表达谱。推测碳水化合物代谢、能量代谢、脂肪代谢、核苷代谢、氨基酸代谢及辅因子和维生素代谢为猪外周血淋巴细胞主要的基础代谢。细胞信号传导路径中MAPK信号通路、钙信号通路、胰岛素信号通路、脂肪细胞因子信号通路、免疫系统中的Toll
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