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目的:在法医学个体识别及亲权鉴定中常会遇到一些特殊案例,肿瘤组织（通常为甲醛固定石蜡包埋组织）成为唯一的参照样本。已有研究表明STR基因座在肿瘤组织中存在变异,使同一个体的肿瘤组织与正常组织STR分型不一致。本研究旨在探讨人鼻咽癌组织的常染色体及Y染色体STR基因座等位基因的变异类型和变异规律,为鼻咽癌组织等特殊检材在法医学实践中的应用奠定基础。方法:1.样本采集:收集病理学诊断明确的79例鼻咽癌患者的癌组织及其正常对照组织。其中12例患者的癌组织为病理活检组织,对照组织为同一个体的口腔拭子。67例患者的癌组织为石蜡包埋组织,对照组织为同一个体的外周静脉血。石蜡包埋组织的固定时间低于一周,保存时间未超过一年。79例鼻咽癌患者中,男性56例,女性23例。记录鼻咽癌患者的相关临床资料（包含性别、年龄、临床分期等）。2.DNA提取:分别采用酚氯仿法提取病理活检组织基因组DNA,Chelex-100法提取口腔拭子和血液样本基因组DNA,TIANamp FFPE DNA Kit试剂盒提取石蜡包埋组织样本基因组DNA。3.STR分型:采用AGCU Expressmarker 22荧光检测试剂盒对提取的样本DNA进行PCR扩增。AGCU Database Y24荧光检测试剂盒对提取的男性DNA样本进行PCR扩增。采用AB 3500遗传分析仪对PCR扩增产物进行毛细管电泳,通过GeneMapper?ID-X软件进行STR分型,对比同一个体正常组织与肿瘤组织的DNA分型,记录STR变异位点和类型。4.统计分析:采用SPSS 13.0软件对数据进行分析,计数资料采用例数和率进行表示,组间比较采用χ2检验。结果:1.样本DNA分型结果本研究中采用酚氯仿法、Chelex-100法、TIANamp FFPE DNA Kit试剂盒提取样本DNA,使用商用试剂盒对提取的DNA样本进行复合扩增,所有基因座均得到完整的STR分型,且STR基因座等位基因峰高≥150RFU（相对荧光单位）。2.鼻咽癌组织常染色体STR与Y染色体STR的变异检测结果使用AGCU Expressmarker 22荧光检测试剂盒,在79例鼻咽癌组织中,有26例检出不同于正常对照组织的STR变异,鼻咽癌组织常染色体STR变异的个体发生率为32.9%。在常染色体STR基因座检出了4种变异类型,其中等位基因增加(Additional allele,Aadd)5例,新等位基因(New allele,Anew)1例,完全杂合性丢失（Complete lost of heterozygosity,LOH）5例,部分杂合性丢失（Partial lost of heterozygosity,pLOH）25例,前三种变异可引起STR基因型改变(STR Genotype Alteration,STRGA),容易导致误判。在22个常用的常染色体STR基因座中共观察到68次变异。变异次数最多的STR是D3S1358（12次）,D7S820、D19S433和Amel基因座未检出变异。D3S1358、D13S317、D16S539、TH01、CSF1PO、vWA、D21S11、D18S51、D6S1043、D8S1179、D12S391、FGA等12个STR基因座发生了导致基因型改变的STR变异,在Penta E、D2S441、TPOX、D2S1338、Penta D、D10S1248、D5S818等7个STR基因座只检出部分杂合性丢失,不会导致STR基因型改变。使用AGCU Database Y24荧光检测试剂盒,在56例男性鼻咽癌组织中,检出2例发生了STRGA,鼻咽癌组织Y染色体STRGA的个体发生率是3.6%。在DYS389Ⅱ和DYS643基因座共观察到2次STRGA,其余22个Y-STR基因座未检测到变异。3.男性鼻咽癌组织常染色体STRGA和Y-STRGA的比较使用AGCU Expressmarker 22荧光检测试剂盒,在56例男性鼻咽癌组织中,有7例检出STRGA,常染色体STRGA的个体发生率是12.5%。在常染色体STR中共观察到13次STRGA,在基因座水平,男性鼻咽癌组织STRGA的发生率是1.055%。通过χ2检验,男性鼻咽癌组织常染色体STRGA与Y-STRGA的个体水平发生率差异无统计学意义（P>0.05）。在基因座水平,常染色体STRGA与Y染色体STRGA的发生率有差异（P<0.05）。4.鼻咽癌组织样本的相关临床资料统计结合目前实验结果与鼻咽癌患者的临床资料分析,通过χ2检验,发现鼻咽癌STR变异在性别、年龄、临床分期等的分布无差异（P>0.05）。结论:1.本研究中鼻咽癌组织在常染色体STR和Y-STR基因座均检出变异。在12个常染色体STR和2个Y-STR基因座检出导致基因型改变的STR变异,说明此14个常用的STR基因座在鼻咽癌组织中的稳定性较差,在鼻咽癌组织与正常对照组织分型结果不一致时,应慎重下结论。2.本研究鼻咽癌组织中未检测到变异的3个常染色体STR和22个Y-STR基因座,可作为鼻咽癌组织个体识别及亲权鉴定的备选基因座,在今后的研究中加大样本量,进一步验证可否将其纳入稳定的STR基因座,为肿瘤组织等特殊检材的个体识别及亲权鉴定提供依据。3.鼻咽癌组织中常染色体STRGA与Y-STRGA的个体水平发生率差异无统计学意义（P>0.05）。在基因座水平,常染色体STRGA的发生率比Y染色体STRGA的发生率高,且二者的差异有统计学意义（P<0.05）,提示鼻咽癌组织中Y-STR基因座的稳定性比常染色体STR基因座的稳定性更好。4.本研究中,鼻咽癌组织常染色体STR变异在性别、年龄、临床分期等的分布无差异,是否与预后相关还需进一步探讨。