拟南芥与油菜GDSL类脂肪酶基因的in silico分析及其对种子油脂积累影响的研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:TSSSSSS
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
油菜是我国主要的食用植物油来源,提高种子含油量一直是油菜育种的主要目标之一。提高油菜种子含油量的努力以往大多集中在增加油脂的有效合成上,然而,阻碍种子油脂的降解,也是提高种子含油量的有效策略,但在目前,尚未被广泛重视。GDSL基因是一类重要的水解酶,能够分解油脂。目前,人们对于油菜基因组中GDSL基因的数目、分布、组织表达特征与功能,特别是其对种子油脂积累的消减作用还缺乏了解。本研究的目的在于了解油菜A基因组中GDSL基因的结构序列特征、在染色体间的分布状况及与拟南芥GDSL基因进化上的关系;掌握部分GDSL基因在模式植物中的时空表达特征、基因位点缺失性突变对种子脂肪酸积累的影响;揭示不同含油量的重组自交系(RILs)与近等基因系(NILs)之间、不同温度条件下,油菜GDSL基因的表达谱特征及其对含油量的影响。主要研究结果如下:(1)通过生物信息学研究手段,在油菜A基因组中共获取141个GDSL基因,在拟南芥中获取了108个GDSL基因,分析了它们的基因的结构,并在此基础上,构建了系统进化树。依据最大似然法(Maximum Likelihood),将油菜A基因组的141个GDSL基因分成3个亚家族;通过对油菜与拟南芥GDSL基因氨基酸序列的同源簇分析,发现两者间共有82组同源基因。利用CIRCOS软件,分别将油菜A基因组与拟南芥的GDSL基因定位在各条染色体上,并把具有对应关系的同源基因用线条连接起来。我们发现,GDSL基因在各条染色体之间呈不均匀分布。此外,利用TargetP1.1Server软件对GDSL基因进行亚细胞定位分析表明,可以定位到分泌途径上的GDSL基因数目最多(共116个)(2)从拟南芥各染色体上,选择了16个GDSL基因进行时空表达模式与缺失性突变功能研究。其中9个基因(AT1G23500、AT1G53900、AT1G54000、AT1G54790、AT1G75890、AT1G75900、AT2G03980、AT2G23540、AT3G09930)在两种或两种以上的组织中同时表达;有3个基因(AT2G19010、AT2G36325和AT5G42170)仅在一种组织中特异表达;另有4个基因(AT1G54010、AT1G58020、AT2G19050、AT2G19060)在根、叶、花蕾、嫩角果和老角果等5种组织中未检测到表达。就GDSL基因在各器官中的表达强度而言,AT1G54000在根中表达较强;AT1G75000、AT2G03980、AT2G19010、AT2G36325、AT5G42170在花蕾中表达较强;AT1G75900和AT2G23540这两个基因在嫩角果中表达较强;而AT2G23540在老角果中表达较强。(3)对突变体研究表明,16个gdsl突变体种子的外部形态没有明显的不同,但千粒重存在显著差异。除at2g19060的种子千粒重低于野生型对照(’Col-0’)外,剩余15个突变体的种子千粒重均不同程度高于野生型,其中atlg53990种子的千粒重比野生型高20%以上。除了at1g53990和at5g42170外,其它14个gdsl突变体种子含油量均高于野生型,其中at2g19060种子的含油量比野生型高30%以上。超微结构观察发现,高含油量gdsl突变体种子细胞中充满油滴数量多,而低含油量突变体种子细胞中则油滴密度小、蛋白体表面积大。在野生型中,占主导地位的脂肪酸主要是亚油酸和亚麻酸,两者占总脂肪酸50%以上;而一半以上的突变体种子这两种组分之和小于50%。(4)油菜高、低含油量重组自交系(RIL-hoc与RIL-loc)在开花后40d至50d种子中的含油量差异显著,但是,在开花后40d, RIL-loc种子细胞中积累较大量的蛋白体,而在RIL-hoc种子中则积累较大量的油滴。RIL-hoc种子油酸和亚油酸含量显著高于RIL-loc.在开花后30d时,GDSL基因在RIL-hoc中的表达量显著高于RIL-loc,在开花后40d,GDSL基因的表达量在两者中基本一致,但至开花后50d, GDSL基因在RIL-loc种子中的表达量则超过了RIL-hoc中的表达量。GDSL基因在低含油量近等基因系(NIL-1)种子中表达量显著高于高含油量近等基因系(NIL-9)的基因数目有46个;反之,则仅有8个基因。表明GDSL基因的大量表达对于分解油滴,降低含油量具有重要的作用。(5)超过80%的GDSL基因在高温诱导下表达量显著高于低温处理。说明在高温处理促进了GDSL基因的大量表达,并导致油脂的大量分解,从而降低了油菜种子细胞中的油脂含量。此外,我们还发现温度与基因型显著的互作效应。无论在高温、常温还是低温处理下,总是有一组更多的GDSL基因在低含油量近等基因系(NIL-1)种子中的基因表达量显著高于高含油量近等基因系(NIL-9)中的表达量。上述的这些发现,加深了人们对于油菜种子油脂积累分子机制的理解。
其他文献
通过对中华人民共和国纬度范围内子午线收敛角的计算,分析陀螺经纬仪定向中计算子午线收敛角对最终定向精度的影响,并通过相关实例计算明确了在不同的情况下子午线收敛角对定
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
司法文明是法治文明的重要内容,从近两年海南省高级人民法院和省人民检察院工作报告来看,海南司法机关通过司法体制改革打造司法文明,通过依法履职输送司法文明,通过司法公信
刘伯温通晓天文地理、格物致知,在饮食方面也曾用心,著有涉及饮食较为专门性著作《多能鄙事》一部。其中与饮食有关的诗词近20首,文章近10篇,与饮食有关的传说近20篇,《多能鄙事》
异源六倍化是普通小麦物种形成的关键性事件,也是普通小麦具有较强环境适应性的主要原因之一。研究表明,异源六倍体小麦形成早期会产生大量的基因表达变化,这说明在六倍体小麦形
<正>多重睑是重睑术后的常见并发症之一,表现为双侧重睑宽度不对称,形成不规则的三眼皮或上睑皮肤多层皱褶,这给求美者带来很大的苦恼。对多重睑的处理方法目前并没有统一的
随着浙江省能源集团“大能源”战略的深入实施,集团产业布局和结构不断得到优化调整。在电力主业做大做强的基础上,集团加强两头延伸,实现了煤炭产业、天然气产业、能源服务业等
卫生事业单位采购工作内容不仅包括行政事业单位日常办公相关采购项目,还涉及到对基础性卫生科研工作所需仪器设备和技术服务的采购。作为重要依托,规划化的采购业务流程及合