论文部分内容阅读
马铃薯是继水稻、小麦之后的世界第三大粮食作物,中国是世界上马铃薯生产量最大的国家。马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)是马铃薯Y病毒科(Potyviridae)马铃薯Y病毒属(Potyvirus)的代表成员,是马铃薯生产中发生普遍并造成严重经济损失的植物病毒之一。了解病毒群体遗传变异的产生及其演化,有助于为制定可持续植病毒防控策略奠定基础。本研究对pipo基因为分子标记,分别比较分析了不同寄主(马铃薯和烟草)和来自马铃薯寄主不同地区群体的PVY遗传多样性及群体分化,并评估突变、选择、基因流等遗传力在其中起的作用。通过pipo基因计算获得的马铃薯和烟草群体分化指数FST为0.120,且统计结果显著,表明烟草和马铃薯寄主的PVY之间中度分化。变异分析显示,烟草和马铃薯分离物pipo基因的核苷酸一致性分别为76.5～100%和93.0～100%,表明烟草PVY变异程度高于马铃薯。通过pipo基因计算烟草和马铃薯群体间的基因流Nm值为1.83,表明这两个群体间存在较强烈的基因流。在pipo基因中未检测到显著地选择位点,表明该基因上的变异不受自然选择影响。同时,对来自我国6个省(福建、湖南、黑龙江、山东、山西、云南)的地区群体分析显示,6个群体的核苷酸多样性(π)均大于0.5%,单倍型多样性(Hd)均大于0.5说明我国各群体的PVYpipo基因具有高度遗传变异的特点。云南群体与其他5个群体间的Fst值均大于0.15,山西群体与其他5个群体间的Fsr值均大于0.11,结合KsT、Z、和Snn三种检验结果可以显示云南和山西两个群体的与其余各群体间的遗传分化显著(P值<0.05),这两个群体具有独特的遗传分化特征。中性检验结合错配分布的结果得出福建群体经历过历史扩张事件。综上结果显示,来自不同地区和不同寄主的PVY遗传多样性差异显著,突变、选择以及基因流等遗传力是影响其遗传多样生和分化程度的主要动力。通过本文的研究,明确了非生物因素(地区)和生物因素(寄主)在PVY进化中的作用。