随着人口的增加和经济的发展，人类对水资源的巨大需求和大规模的开发利用，大大削弱了水资源复合生态系统总体协调程度及承载能力，尤其是20世纪80年代以来，资源环境危机的日益严重，不少国家和地区出现了严重的水资源短缺和生态环境质量明显恶化的现象，这已成为21世纪全球面临的最严峻挑战之一。同时伴随社会发展模式由经济增长型转向资源环境可持续经济发展型的根本性变化，改造和创新水资源问题研究理论，并以生态-环境-经济协调发展为主题对水资源复合生态环境系统进行测度分析，加强水资源合理配置，探讨水资源可持续开发利用分析途径的研究已倍加受到重视。 本文以可持续发展为基本指导思想，运用系统分析理论，在分析国内外研究状况的基础上，从水资源利用潜力和短缺程度、水资源承载能力、安全测度分析等影响要素出发，以综合评估为主线，对区域水资源复合系统体系系统评估进行了探讨分析。以南水北调受益区域为基底，重点探讨并建立了基于供需风险的水资源承载力指标量化因子，建立了水资源持续发展的多目标动态评估模式，深入研究了基于系统协调发展的水资源利用及合理配置决策方法并应用于实践，本文主要讨论了以下几个方面的问题： 1、在系统全面回顾评述了国内外水资源承载力和优化配置理论研究状况的基础上，阐述了水资源承载力和合理配置研究的发展趋势，阐明建立水资源复合生态系统评估决策模式的意义和必要性。在水资源承载力内涵及相关理论研究基础上，从水资源量的支撑能力、经济支撑能力、生态支撑能力以及水资源供水水质的支撑能力等方面对水资源承载力指标进行了量化研究，提出了基于供需风险的水资源承载力测度体系。 2、在水资源复合生态系统中，水资源本身系统开发利用涉及水资源-生态-经济-社会系统的相互作用而耦合而形成一个复杂系统，区域水资源利用的是否合理直接影响经济和大系统的协调发展。本文研究中系统地阐述了水资源复合生态系统内涵，通过对水资源利用变化的影响因素进行分析，提出了水资源供需风险协调系数及其计算方法，构建了与水资源承载力评价指标体系相适应的承载力指数计算理论模式和水资源复合系统发展协调性评估模型，为判定评价水资源复合系统的协调发展提供了一定的理论依据。 3、水资源的配置是人类对水资源进行重新分配和布局的过程，目前，日益提高的国民经济发展已成为水资源管理目标，为了更好地实现区域水资源可持续开发与社会经济的协调发展，进一步加强水资源合理配置的研究将有利于提高区域水资源的承载能力，促进区域复合生态系统的良性循环及可持续发展。