E3泛素化蛋白UBR5作为结直肠癌的新致癌基因和分子靶标

来源 :温州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ruinx
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景:  E3 泛素化蛋白连接酶 UBR5 已经牵涉调控多重生物功能,并且最近已经成为癌症中泛素蛋白酶体系统(UPS)的关键调节分子。然而,UBR5 在结直肠癌(CRC)中的临床意义和生物学功能尚不清楚.  目标:  1.了解UBR5 mRNA,蛋白水平在结直肠癌组织和癌旁正常组织当中的表达模式.  2.用网上TCGA和GEO数据库探索UBR5 DNA水平和mRNA水平和CRC患者临床特征,生存期的相关性.  3.免疫组化用抗-UBR5抗体染结直肠癌组织芯片,了解UBR5 蛋白水平,定位和CRC患者临床特征,生存期的相关性.  4.揭示UBR5表达变化后对结肠癌细胞增殖,侵袭的功能影响.  5.揭示UBR5表达变化后对结肠癌细胞体内成瘤大小的影响.  方法:  1.首先我们下载TCGA上有CRC患者信息的公用的数据(7个GSE8671, GSE9348, GSE22598, GSE23878, GSE37364, GSE14333, and GSE17538数据集),探索CRC 患者UBR5 mRNA在结直肠癌组织和癌旁正常组织的表达情况。其次,我们在长海医院收集了16对结直肠癌患者癌组织和癌旁正常组织标本,抽提 mRNA,用实时荧光定量 PCR 方法检测,以此在我们自己的临床标本验证CRC患者UBR5的表达模式。我们用GSE14333,GSE17538两个数据集合并为经典的MVRM队列,以及TCGA队列(有UBR5拷贝数扩增表达数据)探索UBR5 mRNA表达水平,UBR5 DNA拷贝数,和CRC患者的生存期之间的关系。  2.使用免疫组化的方法,明确结直肠癌组织UBR5蛋白定位。结合临床资料,我们分别分析核表达的UBR5蛋白和细胞质表达的UBR5蛋白与患者生存期,以及患者临床特征之间的联系。  3.在本实验中,为了探索UBR5在CRC进展中的生物学作用,我们评估了UBR5敲低对CRC细胞的增殖潜能和侵袭性的影响。用UBR5 siRNA或者对照siRNA转染细胞或加入dox。UBR5敲低24h后,我们开始评估CRC细胞的增殖,迁移,侵袭和集落形成能力变化。  4.裸鼠皮下接种UBR5/shRNA 结肠癌细胞,在Dox诱导激发下,检测敲低UBR5对结直肠癌细胞体内成瘤大小的影响。  结果:  1. 我们首先分析了五个TCGA平台中公共开放可获得的队列数据集(结直肠癌和癌旁正常组织样本)。有趣的是,和相邻正常组织中的水平比较,UBR5 mRNA水平一致在癌组织中显着上调。使用 RT-QPCR 技术,通过对临床收集的 16对结肠癌和癌旁正常组织的mRNA 进行检测,癌组织中的UBR5 mRNA水平明显高于癌旁组织.  2.因为结肠癌组织中UBR5 mRNA水平显著升高,我们探索了UBR5 mRNA水平和DNA 拷贝数之间的关系。在基因剂量分析中, UBR5 mRNA 水平与 DNA拷贝数都存在明显的正相关关系。  3.我们使用TCGA和MVRM队列探索UBR5 mRNA水平和生存期之间的关系。基于表达值中位数为截值点,把病人分成UBR5 mRNA 表达水平高组和表达水平低组。Kaplan- Meier分析显示,比UBR5 mRNA表达水平低病人,肿瘤中UBR5 mRNA水平高的患者具有较短的无病生存期(DFS)和总生存期(OS)。另外,与UBR5 mRNA表达水平低的患者相比, UBR5 mRNA表达水平高的患者倾向于具有晚期TNM分期。 Mμltivariate Cox分析表明, UBR5 mRNA表达水平高是 DFS 的独立预测因子,包括年龄,性别,TNM 分期为混杂变量。正如Kaplan-Meier所示,UBR5高拷贝数的患者比UBR5低拷贝数的患者OS更短。  4.与UBR5 mRNA相比较,UBR5蛋白表达主要定位于核质,并可能与其UBR5的生物学功能更密切相关。我们发现在7个CRC细胞系中UBR5 mRNA表达显著与他们相应的总蛋白和核蛋白水平相关。CRC与邻近正常组织相比, 核UBR5蛋白表达显著升高。在结直肠癌组织中核UBR5蛋白染色与患者预后生存期相关.Kaplan-Meier 分析显示具有核 UBR5 蛋白表达水平高患者比表达水平低患者有更短的 DFS 和 OS。核 UBR5 蛋白表达水平高与伴有高血清 CA19-9水平相关。Cox多变量分析表明,核UBR5蛋白质表达水平高是DFS独立的预测因子, TNM分期和年龄作为混淆变量因素。  5. 探讨UBR5在CRC中的生物学作用,我们评估了UBR5敲低对CRC细胞的增殖潜力和侵袭性影响。通过在 SW480中,RKO和Caco2细胞使用siRNA和或shRNA,我们敲低UBR5的表达。与对照组细胞相比,通过shRNA表达和siRNA转染UBR5敲低显著抑制SW480,RKO,Caco2细胞增殖,集落形成,迁移和侵袭能力。  6.评估UBR5敲低是否减少体内致瘤性,我们在BALB / c裸鼠皮下注射SW480 / UBR5 shRNA细胞或RKO / UBR5 shRNA细胞,在裸鼠自由饮用的水中加(实验组)或不加(对照)多西环素。在细胞皮下接种细胞20-21天后,UBR5 敲低细胞组肿瘤大小和重量显著低于对照组动物皮下接种肿块。  结论:  在这个研究中,我们比较了CRC组织和相邻正常组织之间的UBR5表 达模式,发现UBR5表达在CRC组织中普遍升高,这可能是染色体多倍体造成。 使用三个CRC患者队列,我们发现患者具有高UBR5 mRNA水平,UBR5基因扩增或UBR5高核蛋白水平预后差。 多变量分析显示UBR5的改变是CRC预后独立预测因子,在TNM分期作为混淆因素。此外,在细胞培养模型中敲低UBR5抑制CRC细胞的增殖,集落形成,迁移和侵袭。体内动物模型进一步证实UBR5敲低减少了CRC肿瘤的生长。 总之,我们的研究是第一个系统探索UBR5的临床和生物学意义的研究,并提出UBR5水平升高起着致癌作用和可能成为CRC的潜在预后指标。
其他文献
公告、通告、通知是国家行政机关正式公文中的三种,也是使用率最高的知照性公文。由于这三种公文功能相近,人们很容易错用、混用及滥用。目前一些公文写作教科书对这三种公
周末电视节目是指双休日白天播出的电视节目,大都是在周六、周日早晨7点至下午的5点,有的台在周日还会延长到6点。这样共40个小时左右为双休节目播出时间段。编导们利用这个白
7月17日至7月20日,《人民日报》、《中国青年报》等权威传媒先后报道的3则经济新闻(事件),背后分别牵涉到3个地方政府的具体行政行为,已引起了社会舆论的广泛关注。3则经济
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。 Please download to view, this article does not support online access to view profile.
期刊
[目的]观察刺五加(Acanthopanax senticosus,AS)对脑出血(intracerebralhemorrhage,ICH)大鼠脑组织细胞凋亡与凋亡调控蛋白Bcl-2、Bax的影响,以及对大鼠血肿周围组织含水量、SOD、MDA水平的影响,探讨AS在ICH时对血肿周围组织细胞的保护作用,为ASI临床应用提供实验依据。[方法]定量胶原酶注入大鼠尾状核建立大鼠ICH模型。126只雄性Wi
在绕线式异步电动机的转子回路中,串接电阻进行调速,这时转子回路的转差功率完全消耗在回路的电阻上。该调速方式的缺点是:电阻及其开关设备占地面积大、效率低、电动机在低
正方体的一些特殊性质并不复杂,亦不难,借助这些特殊性质解与正方体相关的一类立体几何题可收事半功倍之效。 The special properties of the cubes are not complicated, a
烤烟新品种——吉烟七号金祯麟崔昌范玄寿学玄昌善金明子白文三孙金星(吉林省延边农业科学院烟草研究所龙井市133400)张文杰(吉林省烟草公司烤烟新品种吉烟七号是吉林省延边农业科学院
背景:志贺菌又称痢疾杆菌,能侵袭结肠上皮细胞,引起人类细菌性痢疾。按抗原结构和生化反应的不同可分为痢疾(Sh.dysenteriae)、福氏(Sh.flexneri)、鲍氏(Sh.boydii)和宋内氏(
一、研究背景骨髓间充质干细胞(bone marrow mesenchymal stem cells,BMMSCS)自20世纪中期被发现以来,一直备受科学界的关注。BMMSCS来源于中胚层,是一类具有自我复制和多向