产学研合作作为技术创新的有效形式已为我国的经济发展发挥了巨大作用，其中健康的产学研合作机制是其作用得以发挥的关键，产学研合作机制研究也因此成为一项颇具意义的课题。 本文首先分析了我国产学研合作的实施背景和当前中国发展形势对产学研合作研究的新要求，从而明确了系统创新理论对本文的指导地位。 其次对产学研合作的概念和历史进行了回顾并引入两种典型的系统创新理论模型：国家创新体系理论模型和合作创新系统理论模型。在此基础上构造了产学研合作创新系统模型。 最后，以产学研合作创新系统模型为指导，从两个角度对产学研合作机制进行了研究：一、合作生命周期角度；二、系统角度。本部分重点通过五个典型案例，对新形势下产学研合作创新系统中产、学、研、政府、制度、文化等系统要素及其相互关系对产学研合作的影响和作用机理作了深入探讨，揭示了当前产学研合作机制存在的重大问题并提出了改进的建议。 本文的主要结论如下：一、现代企业制度重于技术；二、产权清晰是合作利益机制乃至合作成功的基石；三、开放的科技体制和创新文化是合作成功的保证；四、产学研合作作用的充分发挥有赖于产、学、研各要素的均衡发展。