随着创新驱动发展战略的提出,科技创新已经成为国家发展战略的核心。作为科学研究主要阵地的高等院校,长久以来都在科技创新中扮演着重要角色,投入的科研经费也在逐渐增长。然而,近年来高校频繁曝光的科研经费使用与管理违纪违规案件也引起了社会各界的广泛关注,既给国家造成了经济损失,也给高校自身带来较负面的社会影响,由此自然引发了社会各界对高校科研经费内部控制的讨论与反思。国家层面虽然已经为此推出若干重大改进政策与措施,但如何落实到位非一朝一夕之功。因此,改进和完善高校科研经费内部控制制度十分重要。本文以内部控制相关理论为基础,以案例分析法、问卷调查法等对高校科研经费内部控制进行研究。文章主要以H大学为对象进行研究,目的是找出H大学科研经费的内部控制制度中存在的问题,对造成问题的原因进行分析,并对H大学科研经费内部控制提出建议,实现对科研经费使用的良好控制,期待能为H大学优化内部控制起到一定的借鉴作用。首先,本文阐述了关于研究科研经费内部控制问题的背景,以及在这个背景下研究该问题的必要性与意义,梳理了科研经费及内部控制的相关国内外文献,了解了现有的研究现状与存在的问题;其次,从理论出发,介绍了高等院校在创新驱动发展战略中的重要作用,阐述了高校科研经费以及内部控制的理论基础,对高校的科研经费进行了分类与界定;再次,以H大学为具体案例,根据实地调研介绍了H大学的概况、科研经费来源情况和科研经费内部控制现状,针对H大学内部控制发放了调查问卷,根据问卷结果深入分析了H大学科研经费内部控制存在的问题;最后,基于可行性的考虑,提出符合H大学具体状况的内部控制优化措施。