狮头鹅是广东省特有的家禽品种,是我国仅有的大型鹅种,也是世界上最大型的鹅种之一,具有体型大、生长速度快、耐粗饲、适应性好和抗逆性强等特点。长期以来,狮头鹅长期采用闭锁繁育等技术,育种工作相对滞后,种鹅年产蛋15-70个不等,头颈、体型大小不均,个体生产性能差异大,这一系列问题严重阻碍了狮头鹅产业的发展。以全基因组SNP变异位点为基础的基因组选择技术是新一代的分子育种技术,在白羽肉鸡等多种家禽新品系的培育中成功应用。本研究应用全基因组选择技术,对不同群体的狮头鹅进行全基因组关联分析（GWAS）,挖掘与狮头鹅体型、头围和产蛋性状相关的主要候选基因,并进行验证。研究成果为快速培育高产蛋性能、头大颈粗、体型大的狮头鹅新品系提供技术支持,为开发狮头鹅品种资源及产业化发展提供参考。本团队选育了头大颈粗的狮头鹅育种基础群和正常体貌狮头鹅对照群、高产蛋性状狮头鹅育种基础群和低产蛋性状狮头鹅对照群,并选取马岗鹅、乌鬃鹅、黄宗鹅为体型对照样品。在此基础上,本研究对不同群体的狮头鹅血液DNA样本开展了全基因组重测序工作,利用全基因组关联性分析（GWAS）手段挖掘了狮头鹅体型、头围和产蛋性状的候选基因,并用荧光定量的方法进行验证。研究结果表明:1、通过对全部440份狮头鹅DNA样品、20份马岗鹅DNA样品、20份乌鬃鹅DNA样品、20份黄宗鹅DNA样品进行全基因组测序,选择进化分析筛选出6个与狮头鹅体型性状相关的候选基因。q PCR验证结果表明:PAPPA2基因在狮头鹅群体中的表达量极显著高于马岗鹅、乌鬃鹅和黄鬃鹅群体（P<0.01）,DMP1基因在狮头鹅群体中的表达量显著高于马岗鹅和乌鬃鹅群体（P<0.05）,LCORL、OSTN、IBSP和SPP1基因表达量在狮头鹅、马岗鹅、乌鬃鹅和黄鬃鹅群体中无差异,表明PAPPA2和DMP1基因影响狮头鹅的体型性状。结果表明PAPPA2基因可作为狮头鹅体型性状基因分型的候选基因。2、通过对223份头颈性状的狮头鹅DNA样品进行全基因组测序,关联分析筛选出16个与头围性状相关的候选基因。q PCR验证结果表明:大头围狮头鹅群体中RAP1A基因表达量极显著（P<0.01）低于小头围狮头鹅群体。其他狮头鹅头围性状候选基因在大、小头狮头鹅群体中表达量无差异。结果表明RAP1A基因可作为狮头鹅头围性状基因分型的候选基因。3、通过对217份产蛋性状的狮头鹅DNA样品进行全基因组测序,关联分析筛选出27个与产蛋性状相关的候选基因。q PCR验证结果表明:CRTC1、GPC3、SERPINC1和FAAH2基因在低产蛋狮头鹅群体中的表达量显著高于高产蛋狮头鹅群体（P<0.05）;BMP4、LIF、NFYC和FRMPD3基因在低产蛋狮头鹅群体中的表达量极显著高于高产蛋狮头鹅群体（P<0.01）。MAT5、CLPB和GNA12基因在低产蛋狮头鹅群体中的表达量显著低于高产蛋狮头鹅群体（P<0.05）。结果表明CRTC1、GPC3、SERPINC1、FAAH2、BMP4、LIF、NFYC、FRMPD3、MAT5、CLPB和GNA12与狮头鹅产蛋性状密切相关,可作为狮头鹅产蛋性状基因分型的候选基因。