改革开放以来,我国的城市化过程中出现了农地过速非农化的现象,由此引发了一系列的粮食、耕地以及失地农民保障的问题。然而城市化的速度并没有因保护农业用地而有所降低,于是我国国土资源部出台了一项“城乡建设用地增减挂钩”政策(下称增减挂钩政策)：将农村建设用地(多数为宅基地)复垦为耕地,用复垦的农村建设用地换取城市建设用地指标,来满足高速城市化对土地的需求。增减挂钩政策的出发点是好的,但是违背了事物普遍联系的规律,割裂了宅基地与农业用地之间的联系,将生产和生活完全割裂开来,导致了农民生产和生活的不便。并且该政策没有透过现象看到事物的本质,宅基地向城市建设用地的流转看上去是建设用地内部结构的调整,其本质却是集体所有的土地向国有上地流转,并且以土地征收作为其流转方式。在我国土地征收制度混乱,宅基地征收补偿没有系统规定的情况下,该政策的实施只能是弊大于利。宅基地征收的频繁出现,宅基地征收补偿制度的欠缺导致了社会矛盾不断激化,一部分农民利益受损,一部分城市居民不当得利,地方政府和土地开发商更是从宅基地征收中渔利,宅基地征收中利益分配违背了公平原则。本文从保障农民宅基地利益出发,指出要保障农民在宅基地征收中的利益,核心是对农民宅基地权利的公平合理的补偿,即对农民宅基地使用权进行公平合理的补偿全文一共分为四个部分：第一部分,土地征收中宅基地使用权补偿制度的沿革。主要阐述了农村土地征收的历史必然性,目前宅基地宅基地征收问题频繁出现的背景以及我国宅基地征收补偿法律制度的沿革。第二部分,土地征收中宅基地使用权补偿制度的问题。这一部分指出我国宅基地征收补偿制度的主要问题在于立法对公共利益范围界定模糊,并且由于宅基地的权利结构不清晰,在很大程度上导致了我国宅基地征收补偿不合理。第三部分,土地征收中宅基地权利结构的完善。在土地征收中对于农民利益的保护,从权利结构层面来看,不应该彻底的否认现有的集体土地所有权、赋予农民土地所有权,应该是对集体土地所有权进行改朗。而后再对宅基地使用权进行准确的定性,确认农民宅基地使用权的独立地位,让农民能够依靠手中的宅基地使用权阻止来自集体或者国家的违法征收行为。第四部分,土地征收中宅基地使用权补偿制度的完善。主要研究了宅基地使用权独立补偿的必要性和可行性,宅基地征收补偿应该以公平为补偿原则,以公开交易市场的价格为补偿标准,以宅基地所有权、宅基地使用权、房屋所有权为主要的补偿范围,对宅基地使用权的补偿以产权置换式补偿为主、货币补偿为辅,而无本集体经济组织成员身份的产权人只能获得货币补偿。