新三板市场是我国建设多层次资本市场的重要一环，随着新三板挂牌公司数量的迅速增加，市场交易规模和企业质地大幅提升，新三板也吸引了越来越多的投资者。在新三板上市对企业的要求相较于其他主要板块市场要低，更加关注企业的成长性。因此对新三板的企业进行有效估值，如何做出投资决策具有重要意义。　　根据本文分析，新三板企业具有以下特征：高新技术企业较多、规模小但盈利能力及成长能力强、资金面紧张且负债率高、股权集中度高。基于此，本文针对新三板以上特征，对现金流量贴现法、相对估值法、经济增加值法以及期权估值法的适用性进行深入分析、比较，并由此得出以下结论：经济增加值模型最适用于新三板企业；公司自由现金流量贴现模型在新三板企业估值上受到限制；股权自由现金流量贴现模型在对新三板企业进行估值时适用性较差；股利贴现模型及相对估值模型最不适用于新三板企业估值；期权估值模型是对新三板企业价值评估的有力补充。　　基于以上分析，本文运用构建的模型以新三板挂牌公司益善生物为例评估其价值，同时也运作多种方法进行估值，进一步佐证以上估值方法比较的结论以及对创新性商业模式估值的必要性。　　最后，总结基于EVA和B/S的估值模型在新三板挂牌企业的实际运用中有实际意义，并且也总结了该方法的不足。