目的： 1、建立一个整合子的分析平台，为研究其遗传多样性提供方便； 2、为分析和注释实验获得的整合子数据提供一个比较快捷的通道； 3、比较完全地分析了整合酶附近基因盒内包含的基因的种类和功能； 4、对目前的整合子序列进行整体分布分析，包括年代和国家等。 方法： 1、通过NCBI的RPS-BLAST序列相似性查询工具找出包含整合酶保守域的序列； 2、通过NCBI的API工具eUtils下载被注释为整合子的序列； 3、以Linux为操作平台，采用Apache+PHP+Mysql构建整合子分析平台； 4、对基因盒可能表达的蛋白质分别用PFAM和SUPERFAMILY库从域的水平上进行分析，并采用COG进行了功能水平的分析； 5、采用Perl和BioPerl对收集的数据进行辅助分析和处理。 结果： 1、从收集的整合子来看，大部分基因盒包含的基因和目前已知的基因序列相似性比较低，属于功能未知的基因，如COG的注释结果可以看出，8593个蛋白里有4263个蛋白不能找到相关的信息； 2、各型别的整合酶数量差异非常大，大部分是intI1，而且有很多intI1没有被命名； 3、建立了一个整合子分析平台，将整合子结构以图片的形式公布，更加直观。用户可以对不同来源的整合子进行比较，查看基因盒内基因的详细注释； 4、除了高通量测序得到的uncultured bacterium数据，整合子主要来源于医院内较常见的Pseudomonas，Escherichia，Salmonella和vibrio四个属的菌株，其中又以Escherichia coli和Pseudomonas aeruginosa最多； 5、整合予结构复杂，很多是通过物种来命名，相对比较杂乱，尚需一种新的分类方法来解决。 结论： 1、1类整合子相对其他数量比较多，intI1已经是基因盒传递的一个比较适合的媒介；Ⅱ类整合子酶活性低，这与目前临床上发现含Ⅱ类整合子的菌株比较少一致； 2、各型别之间整合酶序列差异不显著，尤其序列的保守结构域，但其作用的位点差异比较明显，甚至是7bp的结构也有些不符合规则； 3、分析平台的建立，可以为今后研究整合子的结构和演变提供更方便的有用信息； 4、高通量测序技术的发展，使整合子的数据来源越来越丰富，对院外整合子的分析可以促进这一可移动遗传元件的研究。