在蛋白质的泛素—蛋白酶体降解途径中，蛋白质的泛素化与去泛素化是一个极其复杂而关键的过程。泛素羧基端水解酶可特异性地切除泛素羧基端融合的氨基酸或肽链，无论从结构和功能上讲，都可以说是大量去泛素化酶中极具有代表性的一个家族。为了研究UCH家族在去泛素化反应中是否具有底物特异性的问题，我们将泛素第45位的苯丙氨酸突变为色氨酸（UbF45W），并在此基础上于原核表达系统中构建一系列在泛素羧基端融合的第一个残基存在差异的肽段（UbF45W—Xaa—His6tag）作为酶切反应的底物。在反应中止后用Ni柱亲和层析的方法除去反应体系中带有His6标记的蛋白质，然后通过荧光测定反应产物UbF45W的浓度，进而定量计算出不同泛素羧基端水解酶的酶解活力。实验结果显示，UCH—L1，UCH37对于X位不同的泛素融合蛋白是具有底物选择性并且彼此间存在差异，而UCH—L3则不具有底物选择性。